在民事借贷纠纷立案后，父母通过私下沟通还清欠款是可以的，但需要注意一些法律程序和细节。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 还款的合法性：

   • 无论是在立案前还是立案后，只要借款人（或其父母作为还款人）按照约定的金额和方式还清了欠款，这种还款行为都是合法的。还款后，借款人与出借人之间的债权债务关系即告消灭。

2. 还款后的法律程序：

   • 撤诉申请：如果案件已经立案但尚未开庭审理，借款人（或其父母）可以与出借人协商，由出借人向法院提交撤诉申请。法院在审查撤诉申请后，如果认为符合撤诉条件，会裁定准予撤诉，案件即告终结。
   • 和解协议：如果案件已经进入审理阶段，借款人（或其父母）与出借人可以达成和解协议，明确还款事实及双方权利义务的终结。和解协议可以提交给法院，由法院根据和解协议制作调解书或裁定书，从而终结案件。
   • 还款证明：无论选择哪种方式，借款人都应保留好还款的凭证，如银行转账记录、收据等，以证明欠款已经还清。这些凭证在后续的法律程序中可能起到关键作用。

3. 注意事项：

   • 及时沟通：借款人（或其父母）应尽早与出借人沟通还款事宜，避免案件进一步恶化或产生不必要的法律费用。
   • 书面确认：为了确保还款事实得到双方的认可，建议还款行为以书面形式进行确认，如签订还款协议或出具收据等。
   • 法院程序：如果案件已经进入法院程序，借款人（或其父母）应了解并遵守法院的相关规定和程序，如提交撤诉申请或和解协议等。

4. 可能的法律后果：

   • 如果借款人（或其父母）在立案后还清了欠款，但未按照法律程序进行撤诉或和解，可能会导致案件继续审理，从而产生不必要的法律费用和时间成本。
   • 如果借款人（或其父母）未保留好还款凭证或无法证明欠款已经还清，可能会面临出借人继续追讨欠款的风险。

建议：在民事借贷纠纷立案后，如果父母通过私下沟通还清了欠款，借款人应及时与出借人沟通并办理相关法律程序，如撤诉或和解等，以确保案件得到妥善解决。同时，保留好还款凭证以备不时之需。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。