结论：概算批复是煤炭定额而合同为土建定额结算，二者之间确实存在矛盾，但这种矛盾是否构成法律上的问题或影响合同效力，需结合具体情况分析。
分析角度一：合同条款的明确性与优先性
合同条款的明确性：在建设工程合同中，定额标准是确定工程价款的重要依据。若合同中明确约定了使用土建定额进行结算，则该条款具有明确的法律效力，双方应严格按照合同约定执行。
合同条款的优先性：即便概算批复中提及了煤炭定额，但合同作为双方意思表示一致的产物，其条款在双方之间具有优先效力。除非合同存在无效或可撤销的情形，否则概算批复中的定额标准不应影响合同的执行。
分析角度二：概算批复的性质与作用
概算批复的性质：概算批复通常是项目立项或初步设计阶段，由相关部门对项目总投资额的初步估算和批准。它并不直接构成合同的一部分，也不对合同的具体条款产生直接约束力。
概算批复的作用：概算批复主要作为项目资金筹措和管理的依据，确保项目总投资控制在批准的范围内。它并不决定合同中具体工程价款的结算方式或定额标准。
分析角度三：矛盾的处理方式
协商解决：当概算批复与合同条款存在矛盾时，双方应首先通过协商的方式寻求解决方案。可以依据合同条款的约定，结合项目的实际情况，对定额标准进行适当调整或明确。
法律途径：若协商无果，双方可以通过法律途径解决争议。在诉讼或仲裁过程中，法院或仲裁机构将依据合同条款的约定、相关法律法规的规定以及项目的实际情况，对定额标准进行认定和裁决。
法律建议：
审查合同条款：建议双方首先仔细审查合同条款，明确合同中关于定额标准的约定，确保双方对合同条款的理解一致。
保留相关证据：在处理矛盾过程中，双方应保留好与概算批复、合同条款以及项目实际情况相关的所有证据，以便在协商或法律途径中证明自己的主张。
寻求专业法律意见：鉴于定额标准在建设工程合同中的重要性，建议双方在处理矛盾时寻求专业律师的法律意见，以确保自己的权益得到充分保障。
可能后果：
若双方无法就定额标准达成一致，且未通过协商或法律途径解决争议，可能导致工程价款结算延误、项目进度受阻甚至合同解除等严重后果。因此，建议双方务必重视定额标准的矛盾问题，及时采取有效措施予以解决。