末位扣工资一般是不合法的。以下从不同角度为你详细分析：
法律角度
根据《中华人民共和国劳动法》以及《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。工资分配应当遵循按劳分配原则，实行同工同酬。这意味着，用人单位不能仅凭劳动者在考核中处于末位就扣减其工资，因为考核末位并不直接等同于劳动者不能胜任工作，也不意味着其劳动成果未达到应得的报酬标准。
考核制度角度
考核制度的合法性：如果用人单位的考核制度明确规定了末位扣工资的条款，并且该制度已经经过民主程序制定（如职工代表大会讨论、与工会或职工代表协商等），且内容不违反法律、行政法规的强制性规定，同时已经向劳动者公示或告知，那么从制度层面看，该条款可能具有一定的合法性基础。但即便如此，仅凭末位就扣工资仍然可能因违反按劳分配原则而被认定为无效。
考核结果的合理性：即使考核制度合法，用人单位在依据考核结果扣减工资时，也必须确保考核结果的合理性。如果考核过程存在不公正、不透明或主观臆断的情况，导致劳动者被错误地评为末位，那么用人单位据此扣减工资的行为就可能构成违法。
实际操作角度
在实际操作中，用人单位往往难以证明末位与劳动者不能胜任工作之间的直接关联。因为考核末位可能受到多种因素的影响，如考核标准的不合理性、考核过程的公正性、劳动者个人的身体状况、家庭情况等。因此，用人单位仅凭末位就扣减工资的做法，很容易引发劳动争议。
建议
对于劳动者：如果你遇到了末位扣工资的情况，首先应当查看自己的劳动合同和用人单位的规章制度，了解是否有相关条款。如果没有或相关条款违法，你可以向用人单位提出异议，并要求其补发被扣减的工资。如果用人单位拒绝，你可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
对于用人单位：建议用人单位在制定考核制度时，确保制度的合法性和合理性，并明确考核标准、考核程序以及考核结果的应用方式。在依据考核结果进行工资调整时，应当确保调整的合理性和公正性，避免仅凭末位就扣减工资的做法。
总之，末位扣工资一般是不合法的。如果你遇到了相关问题或有任何疑问，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议。