收集物证、书证不符合法定程序，确实可能包含证据保管规定方面的问题，但并不必然导致证据被排除，关键在于程序违规的严重程度及其对司法公正的影响。以下从多个角度为你详细分析：

一、法律依据与核心原则

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第五十二条，审判人员、检察人员、侦查人员必须依照法定程序收集证据，严禁非法方法取证。
   • 《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国刑事诉讼法〉的解释》第一百二十六条进一步规定，收集物证、书证不符合法定程序，可能严重影响司法公正的，应当予以补正或者作出合理解释；不能补正或者作出合理解释的，对该证据应当予以排除。

2. 核心原则：

   • 维护程序合法性与司法公正，避免因细微程序瑕疵轻易排除关键证据。
   • 保障刑事诉讼活动的顺利进行和实体正义的实现。

二、证据保管规定与程序违规

证据保管规定是法定程序的重要组成部分，它确保了证据的完整性、真实性和可靠性。当收集物证、书证时，如果违反了证据保管规定，比如未妥善保管导致证据损坏、丢失或被篡改，这就构成了程序违规。然而，并非所有程序违规都会导致证据被排除，关键在于违规的严重程度及其对司法公正的影响。

三、具体处理方式

1. 补正与合理解释：

   • 如果程序违规是非实质性的，比如遗漏了签名、日期等，可以通过补正来挽救证据的效力。
   • 如果程序违规有合理的解释，比如由于紧急情况或不可抗力导致无法按照正常程序收集证据，也可以作出合理解释。
   • 经补正或合理解释后，若审查机关认为不影响证据使用的，该证据可继续作为定案依据。

2. 排除：

   • 如果程序违规严重，且无法补正或作出合理解释，比如证据被严重损坏、丢失或被篡改，导致无法证明其真实性、可靠性，那么该证据应依法被排除。
   • 排除证据是为了维护司法公正和诉讼参与人的合法权益，防止因非法证据导致的误判。

四、审查要点与注意事项

1. 审查物证、书证是否为原物、原件：

   • 原物、原件因其未经加工、更改，具有较高的证明力。
   • 如果只有复制品，需严格审查其制作过程的合法性，包括制作人数量、制作说明、侦查员、制作人、见证人的签名或盖章等。

2. 综合考虑多方面因素：

   • 在判断“可能严重影响司法公正”时，需综合考量程序违法的性质、程度以及对证据真实性、可靠性产生的影响。
   • 比如，如果程序违规只是轻微的瑕疵，且不影响证据的真实性和可靠性，那么可能不需要排除该证据。

五、实际案例与启示

在实际案例中，曾有因证据保管不善导致证据被排除的情况。比如，某起案件中，侦查人员在收集物证时未按照法定程序进行封装和标记，导致物证在后续诉讼中无法证明其真实性、可靠性，最终被法院排除。这启示我们，在收集物证、书证时，必须严格遵守法定程序和证据保管规定，确保证据的完整性和真实性。

总结来说，收集物证、书证不符合法定程序可能包含证据保管规定方面的问题，但并不必然导致证据被排除。关键在于程序违规的严重程度及其对司法公正的影响。如果程序违规是非实质性的或可以作出合理解释，那么证据可能继续有效；如果程序违规严重且无法补正或解释，那么证据应被排除。如果你在合同纠纷中遇到了类似问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况给出更详细的法律建议。