结论前置：公司离职证明中写竞业限制三年且声称工资里包含补偿金，离职后不再补的做法，在多数情况下是不合法且不合理的。下面我将从多个角度为你详细分析。
一、竞业限制期限的合法性
根据《劳动合同法》的相关规定，竞业限制期限不得超过二年。因此，公司离职证明中写竞业限制三年，这一期限本身就超出了法律规定的上限，是违法的。即使双方在劳动合同或竞业限制协议中有此约定，该约定也因违反法律强制性规定而无效。
二、竞业限制补偿金的支付
补偿金是否应包含在工资中：
- 竞业限制补偿金是公司为了限制员工在离职后一定期限内从事与本公司有竞争关系的工作而支付的费用。这笔费用应当单独支付，而不应包含在员工日常的工资中。
- 如果公司声称工资中已经包含了竞业限制补偿金，那么它需要提供充分的证据来证明这一点，比如工资条中明确列出了竞业限制补偿金的金额，或者双方在劳动合同中有明确的约定。否则，这种说法是不被法律认可的。
离职后是否应继续支付补偿金：
- 如果双方签订了有效的竞业限制协议，并且协议中约定了补偿金的支付方式和期限，那么公司应当按照协议约定继续支付补偿金，直到竞业限制期限届满。
- 如果公司拒绝支付补偿金，员工有权要求公司支付，并且可以通过法律途径来维护自己的权益。
三、你的权益与应对措施
审查竞业限制协议：
- 首先，你需要仔细审查你与公司签订的竞业限制协议，看看协议中关于竞业限制期限和补偿金的支付是否有明确的约定。
- 如果协议中的期限超过了二年，或者补偿金的支付方式不明确、不合理，你可以与公司进行协商，要求修改协议或者解除竞业限制义务。
与公司沟通：
- 你可以与公司的人力资源部门或者相关负责人进行沟通，明确表达你的诉求和疑虑。
- 要求公司提供工资中包含竞业限制补偿金的证据，或者按照协议约定继续支付补偿金。
寻求法律帮助：
- 如果公司拒绝沟通或者拒绝支付补偿金，你可以考虑寻求法律帮助。
- 你可以向我咨询具体的法律程序和维权策略，我会根据你的具体情况为你提供专业的法律建议。
四、可能的法律后果
如果公司违法约定竞业限制期限：
- 该约定无效，员工不受该期限的限制。
- 公司可能面临劳动行政部门的处罚。
如果公司拒绝支付竞业限制补偿金：
- 员工有权要求公司支付补偿金，并且可以通过法律途径来追讨。
- 如果员工因此遭受了损失，公司还需要承担赔偿责任。
最后建议：面对这种情况，我建议你先与公司进行友好沟通，明确表达你的诉求和疑虑。如果沟通无果，你可以考虑寻求法律帮助来维护自己的权益。如果你有任何疑问或者需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。