公司违法所得的计算需结合具体侵权情节、销售金额、成本扣除及法律责任类型综合判定。针对您描述的“法定代表人以个人名义采购侵权商品，以公司名义对外销售”的情形，需从以下角度分析：

一、违法所得的认定逻辑

根据《反不正当竞争法》《商标法》等法律，违法所得通常指“实施侵权行为所获得的全部收入扣除直接成本后的余额”。但需注意：

1. 收入范围：以公司名义销售侵权商品的全部收入（包括货款、服务费等）均需纳入计算，无论是否实际入账公司账户。
2. 成本扣除：仅允许扣除与侵权行为直接相关的成本（如采购侵权商品的支出、运输费、包装费等），但不得扣除法定代表人个人采购时的非必要支出（如个人消费、与侵权无关的费用）。
3. 举证责任：公司需自行证明成本的真实性与合理性，否则可能被全额认定为违法所得。

二、具体计算方式

1. 公式化计算

违法所得 = 销售侵权商品的总收入 - 直接成本
示例：

• 总收入：公司销售侵权商品共收款100万元（含税）。
  
• 直接成本：采购侵权商品支出60万元 + 运输费5万元 = 65万元。
  
• 违法所得：100万元 - 65万元 = 35万元。

2. 特殊情形调整

• 若法定代表人个人采购时存在虚开发票、套取资金等行为：虚增的成本部分（如虚构的采购价）不得扣除，需按实际成本重新计算。
  
• 若公司未建立完整财务账目：市场监管部门可能根据《行政处罚法》推定违法所得为“销售收入的全部”（即100万元），公司需承担举证不能的后果。

三、法律责任与风险延伸

1. 行政责任：

   • 根据《商标法》第六十条，公司可能被处以“违法所得一倍以上五倍以下罚款”（即35万元至175万元）。
     
   • 若违法所得难以计算，市场监管部门可按“经营额”（如100万元）的20%至50%罚款（即20万元至50万元）。

2. 刑事责任风险：

   • 若违法所得数额较大（如超过5万元）或存在其他严重情节（如销售假冒注册商标的商品罪），公司及法定代表人可能被追究刑事责任。
     
   • 关键点：法定代表人以个人名义采购侵权商品的行为，可能被认定为“公司意志的体现”，导致公司承担共同侵权责任。

3. 民事赔偿风险：

   • 权利人可依据《商标法》第六十三条要求公司赔偿“实际损失”或“侵权获利”（即违法所得35万元）。
     
   • 若权利人因侵权受到商誉损失等间接损害，法院可能酌情提高赔偿金额。

四、实务建议

1. 立即停止侵权行为：封存剩余侵权商品，停止销售并下架相关宣传资料。
   
2. 固定证据：保留采购合同、付款记录、销售发票等，证明成本的真实性与合理性。
   
3. 协商和解：与权利人沟通赔偿事宜，争取降低行政处罚或刑事风险。
   
4. 内部追责：若法定代表人存在故意或重大过失，公司可向其追偿损失。

提示：违法所得的计算需结合具体证据和执法部门认定，建议携带相关材料进一步向我咨询，以便制定针对性应对方案。