关于您提出的“本科实习协议会被查吗”这一问题，我可以从几个方面为您详细解答。
首先，实习协议本身是实习生与实习单位之间为了明确双方权利和义务而签订的书面文件。它不属于劳动法规定的劳动关系范畴，但依然是一种平等的民事关系协议。这份协议对于保障实习生的权益至关重要，它详细规定了实习内容、工作时间、报酬待遇以及是否提供实习证明等关键信息。
关于实习协议是否会被查的问题：
学校层面的核查：
- 学校在关注学生实习情况时，可能会要求学生提供实习协议作为实习证明的一部分。这是为了确保学生确实在正规单位进行了实习，并且实习内容符合学校的教学要求。
- 学校还可能通过访谈学生、回访用人单位等方式，对实习情况进行严格核查，以确保实习的真实性和有效性。
教育部门的核查：
- 教育部等教育部门在特定情况下，如针对高校就业率造假现象的专项核查中，可能会要求高校提供学生的就业协议书、劳动合同等材料进行审核。虽然这主要针对的是正式就业签约，但实习协议作为学生实习经历的重要证明，也可能在相关核查中被涉及。
- 教育部门通过核查这些材料，旨在确保就业签约和就业统计数据的客观、准确，维护教育公平和学生权益。
法律层面的监管：
- 如果实习单位存在违法行为，如利用实习协议设置不公平、不合理或违法的条款，实习生有权向相关部门投诉或寻求法律援助。在这种情况下，实习协议可能成为法律监管和调查的重要依据。
建议：
- 签订正式实习协议：为了保障自身权益，建议您在实习前与实习单位签订正式的实习协议，并认真阅读协议内容，确保所有条款都明确、合理。
- 留存沟通记录：如果实习单位未签署书面实习协议，而是口头告知实习内容及报酬安排，您应当注意留存相应的沟通记录，以备不时之需。
- 了解市场工资水平：在签署实习协议前，建议您对市场的工资水平有初步的了解，避免盲目接受薪酬与行业平均水平不匹配的实习工作。
综上所述，虽然实习协议本身不是直接被“查”的对象，但在学校、教育部门或法律层面的监管和核查中，它可能作为重要证明材料被涉及。因此，签订一份正式、明确的实习协议对于保障您的实习权益至关重要。