结论：身体原因申请免值夜班拿6成薪资是否合理不能一概而论，需分情况讨论。

1. 从劳动合同约定角度
   • 如果劳动合同中明确约定了值夜班是工作内容的必要组成部分，并且对于薪资构成有详细规定，比如值夜班有额外的夜班津贴，或者薪资与工作时长、工作强度等有直接关联，那么因身体原因免值夜班导致薪资变为6成是否合理，要看合同中是否有关于此类情况的特殊约定。
   • 若合同中有明确规定，因个人身体原因无法完成合同约定的工作内容（值夜班），公司可以按照一定比例调整薪资，且该比例的约定不违反法律法规的强制性规定，那么公司拿6成薪资的做法可能是合理的。
   • 若合同中没有此类约定，公司单方面将薪资降为6成则缺乏合同依据，这种做法可能不合理。
2. 从法律法规角度
   • 根据《中华人民共和国劳动法》等相关法律法规，用人单位不得随意降低劳动者的工资。劳动者因身体原因不能值夜班，这属于劳动者身体状况发生变化的合理情形，用人单位应当根据实际情况进行合理调整。
   • 如果免值夜班并没有导致劳动者实际提供的劳动价值大幅降低，用人单位将薪资降为6成可能缺乏合理性。例如，劳动者虽然免值夜班，但白班的工作任务和强度并没有减少，仍然按照正常的工作要求完成了工作任务，此时用人单位降低薪资就可能违反了法律规定。
   • 然而，如果值夜班对于公司业务的正常开展至关重要，且免值夜班确实给公司带来了一定的损失或额外成本，用人单位在与劳动者协商一致的情况下，可以适当调整薪资，但调整的比例应当合理，不能过度损害劳动者的利益。
3. 从协商与公平角度
   • 劳动者因身体原因提出免值夜班，这是一个合理的诉求。在这种情况下，用人单位和劳动者应当进行充分的协商。双方可以就薪资调整的比例、方式等进行沟通，寻求一个双方都能接受的解决方案。
   • 如果双方能够通过协商达成一致，将薪资调整为6成，并且这种调整是基于公平合理的原则，考虑到公司的实际运营情况和劳动者的身体状况，那么这种做法是可以接受的。
   • 如果双方无法协商一致，用人单位单方面将薪资降为6成，可能会引发劳动纠纷，此时劳动者可以通过申请劳动仲裁等方式来维护自己的合法权益。