针对食品案件被罚款几百万的情况，企业或个人应采取以下步骤处理：

1. 核实罚款依据与程序合法性
   首先需确认罚款的法律依据（如《食品安全法》第122-125条）及行政机关的执法程序是否合法。例如，罚款是否基于充分的证据链（如检测报告、现场笔录等），是否履行了告知、听证等法定程序。若存在程序违法（如未告知救济权利）或适用法律错误（如错误认定违法行为性质），可依法申请行政复议或提起行政诉讼，要求撤销或变更处罚决定。

2. 评估违法行为性质与处罚幅度合理性
   根据《食品安全法》，罚款金额通常与违法所得、货值金额挂钩。例如：

   • 无证生产：货值金额不足1万元的，处5万-10万元罚款；货值金额1万元以上的，处货值金额10-20倍罚款；
     
   • 经营过期食品：货值金额不足1万元的，处2000元-5万元罚款；货值金额1万元以上的，处货值金额5-10倍罚款。
     若行政机关计算的货值金额或倍数存在明显错误（如将零售价误认为进货价），可提出异议并要求重新核算。

3. 主动整改与申请减轻处罚
   若违法行为属实，但存在从轻或减轻情节（如主动召回产品、配合调查、未造成严重后果等），可在收到处罚决定书后3日内向行政机关提交《陈述申辩书》，附上整改证明、财务损失报告等材料，申请降低罚款金额。根据《行政处罚法》第32条，行政机关应予以复核并书面答复。

4. 分阶段履行或申请延期缴纳
   若罚款金额过高导致短期内无法全额缴纳，可依据《行政处罚法》第72条，在收到处罚决定书后15日内向行政机关申请分期缴纳或延期缴纳，并说明资金困难原因（如银行账户冻结、经营停滞等）。行政机关批准后，需按约定时间履行，否则可能面临每日3%的加处罚款。

5. 刑事风险排查
   若违法行为涉嫌犯罪（如生产销售有毒有害食品罪），行政机关可能将案件移送公安机关。此时需立即委托律师介入，评估是否符合刑事立案标准（如是否造成人身损害、是否使用禁用物质等），并制定辩护策略（如争取不起诉、缓刑等）。

行动建议：

• 收到《行政处罚事先告知书》后，务必在3日内提出陈述申辩，逾期视为放弃权利；
  
• 罚款金额超过50万元的案件，建议委托专业律师参与听证或复议/诉讼程序；
  
• 整改措施需留存书面证据（如召回公告、整改报告、第三方检测报告等），以增强申辩说服力。
  

如有具体案件细节（如处罚事由、货值金额、整改情况等），可进一步向我咨询，我将结合《食品安全法》《行政处罚法》及相关司法解释提供针对性方案。