结论：公司不能仅因员工拿公司资金拒不退还就暂停工资发放。

分析如下：

1. 工资发放的法律依据：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，工资是劳动者因提供劳动而应得的报酬，用人单位应当按时足额支付。这是用人单位的法定义务，不得随意克扣或拖欠。

2. 员工拿公司资金拒不退还的性质：

   • 员工拿公司资金拒不退还，这通常涉及到侵占公司财产的问题，可能构成违法行为，如职务侵占等。但这与工资发放是两个独立的法律关系。

3. 公司暂停工资发放的合法性：

   • 公司不能因为员工侵占公司财产就暂停其工资发放。工资是员工应得的劳动报酬，与员工是否侵占公司财产无直接关联。公司应当通过合法途径，如报警、提起民事诉讼等，来追讨被侵占的资金，而不是采取暂停工资发放这种违法行为。

4. 公司应采取的合法措施：

   • 如果公司发现员工侵占公司财产，应当立即收集证据，并向公安机关报案，或者向人民法院提起民事诉讼，要求员工返还侵占的资金并赔偿损失。
   • 同时，公司也可以依据内部规章制度，对员工进行纪律处分，如警告、记过、解除劳动合同等。但这些处分措施必须合法合规，不能侵犯员工的合法权益。

5. 可能的法律后果：

   • 如果公司擅自暂停员工的工资发放，可能面临劳动行政部门的处罚，如责令支付工资、加付赔偿金等。
   • 员工也有权向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司支付拖欠的工资及经济补偿等。

建议：

• 公司应当严格遵守法律法规，按时足额支付员工工资，不得随意克扣或拖欠。
• 如果发现员工侵占公司财产，应当通过合法途径追讨，并依据内部规章制度进行纪律处分。
• 在处理此类问题时，建议公司咨询专业律师，以确保处理方式的合法性和有效性。

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