在《行政处罚法》中，并非所有违法所得都必须没收，而是遵循“除依法退赔外，应当予以没收”的原则。以下是对这一问题的详细分析：
一、违法所得的定义与处理原则
根据《行政处罚法》第二十八条第二款的规定，违法所得是指实施违法行为所取得的款项。对于违法所得的处理，主要遵循以下原则：
应当退赔的情形：当存在受害人时，违法所得中应当返还给受害人的部分需要依法退赔。例如，商家以欺诈手段多收取消费者的货款，这部分多收的货款就属于应当退赔给消费者的违法所得。行政机关会责令当事人将该部分款项退还给受侵害的消费者。
予以没收的情形：除了应当退赔给受害人的部分外，剩余的违法所得行政机关应当予以没收。没收违法所得是行政处罚的一种，旨在剥夺当事人因违法行为所获得的经济利益，起到惩戒和预防违法的作用。
二、违法所得的计算与特殊规定
一般计算方式：一般情况下，违法所得是指实施违法行为所取得的款项。
特殊规定：如法律、行政法规、部门规章对违法所得的计算另有规定的，则按照这些特别规定来计算。例如，在一些知识产权侵权案件中，可能会规定以侵权人因侵权所获得的利润或者被侵权人因被侵权所受到的损失来确定违法所得的数额。
三、违法所得与罚款的关系
根据《行政处罚法》第二十九条的规定，对当事人的同一个违法行为，不得给予两次以上罚款的行政处罚。这意味着，如果一个违法行为同时产生了违法所得和需要罚款的情况，不会同时对同一行为进行两次罚款，而是会选择罚款数额较高的那一项进行处罚。而违法所得则会被单独处理，即除依法退赔外，应当予以没收，不受罚款的影响。
四、法律程序与救济途径
行政机关在作出没收违法所得的行政处罚决定时，必须遵循法定的程序，包括立案、调查取证、告知当事人权利、举行听证（符合听证条件时）、作出处罚决定、送达处罚决定书等。当事人对没收违法所得的行政处罚决定不服的，可以依法申请行政复议或者提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。
五、实际案例说明
以某企业未经许可生产销售劣质产品为例，其销售该劣质产品所获得的全部收入，在扣除应退还给消费者的部分后，剩余的违法所得将被行政机关依法没收。这一过程中，行政机关会严格遵循法定程序，确保处罚的合法性和公正性。同时，企业也有权对处罚决定提出异议，并通过法律途径维护自己的权益。
总结与建议：在处理违法所得时，行政机关会遵循“除依法退赔外，应当予以没收”的原则，并根据具体情况选择适当的处罚措施。如果你或你的企业面临相关情况，建议直接向我咨询，以获取更准确的法律意见和帮助，确保自身权益得到有效维护。