结论：合同上写明一式两份但只有一份签字，这份合同的法律效应需分情况讨论，不一定完全无效，但可能存在效力瑕疵或履行风险。以下从不同角度详细分析：

1. 合同成立与生效的基本原则

根据《民法典》第四百九十条，合同成立需满足“双方意思表示一致”的核心要件。若双方已就合同内容达成合意（如通过口头协商、邮件确认等），即使仅一份签字，合同仍可能成立。但需注意：

• 签字是书面合同生效的关键形式要件：若合同明确约定“双方签字后生效”，且未签字方未通过其他方式（如盖章、按手印）确认，则未签字方可能主张合同未生效。
• 例外情形：若未签字方已实际履行合同主要义务（如支付货款、交付货物），根据《民法典》第四百九十条第二款，可视为合同已成立并生效。

示例：甲乙签订买卖合同，约定一式两份，但仅甲签字。若乙已支付定金，则合同可能因乙的实际履行而生效。

2. “一式两份”条款的法律意义

“一式两份”通常属于合同中的格式条款，其目的在于：

• 保障双方持有合同原件：便于核对条款、固定证据。
• 避免单方篡改风险：若一方持有唯一签字件，可能通过修改条款损害对方利益。

法律后果：

• 若仅一份签字，但双方均认可合同内容（如通过聊天记录、录音等佐证），法院可能认定合同有效，但会要求签字方提供另一份未签字合同以核对内容。
• 若签字方拒不提供另一份合同，且未签字方主张条款被篡改，法院可能因证据不足而否定部分条款效力。

3. 未签字方的抗辩权

未签字方可以主张：

• 合同未成立：若其未在合同上签字，且未通过其他方式表示接受合同条款（如未实际履行），可主张合同未成立。
• 重大误解或显失公平：若签字方利用未签字方对合同条款的误解（如未交付合同副本），未签字方可依据《民法典》第一百四十七条、第一百五十一条主张撤销合同。

示例：甲伪造合同内容，仅让乙在一份合同上签字，乙发现后可主张合同因欺诈而可撤销。

4. 实务建议

为避免纠纷，建议：

1. 严格履行签字程序：确保双方均在两份合同上签字或盖章，并各自留存原件。
2. 补充确认方式：若因客观原因无法同时签字，可通过邮件、短信等方式确认合同内容，并保留证据。
3. 及时核对合同：签字后尽快核对两份合同内容是否一致，若发现差异立即协商修改。

总结：合同仅一份签字是否有效，需结合双方合意、实际履行情况及证据综合判断。若您遇到此类纠纷，可直接向我咨询，我会根据具体条款和证据为您分析风险并提供解决方案。