关于您提出的“是否可以起诉员工缴纳个人部分社保公积金”的问题，这实际上涉及到了用人单位与劳动者在社会保险和公积金缴纳方面的法律责任与义务。以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，根据《中华人民共和国社会保险法》和《中华人民共和国劳动法》的相关规定，用人单位有义务为劳动者办理社会保险登记，并按时足额缴纳社会保险费。这包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险等。同时，职工应当缴纳的社会保险费由用人单位代扣代缴，用人单位应当按月将缴纳社会保险费的明细情况告知本人。对于公积金，虽然相关法律可能有所不同，但原则上用人单位也有义务为劳动者缴纳公积金，并代扣代缴劳动者个人应承担的部分。

现在，针对您的问题，如果用人单位已经为劳动者办理了社会保险和公积金登记，但劳动者个人应承担的部分未从其工资中扣除或未缴纳，这通常不是劳动者的过错，而是用人单位在管理或操作上的失误。在这种情况下，用人单位一般不能直接起诉劳动者要求其缴纳个人部分的社保公积金。因为根据法律规定，用人单位有义务代扣代缴劳动者个人应承担的社会保险费和公积金。

然而，如果用人单位已经为劳动者垫付了其个人应承担的社会保险费和公积金，并且有证据证明这一点（如补缴记录、工资条等），那么用人单位在特定情况下是有权向劳动者追偿的。这通常发生在用人单位事后补缴社保和公积金时，发现劳动者个人应承担的部分未缴纳，且该部分费用已由用人单位垫付。在这种情况下，用人单位可以通过法律途径要求劳动者返还其垫付的个人部分社保公积金。

但需要注意的是，追偿的前提是用人单位已经履行了其法定的缴纳义务，并且有充分的证据证明其垫付了劳动者个人应承担的部分。如果用人单位本身就存在未依法为劳动者缴纳社保和公积金的情况，那么其要求劳动者返还垫付费用的请求可能不会得到法院的支持。

综上所述，一般情况下用人单位不能直接起诉劳动者要求其缴纳个人部分的社保公积金。但如果用人单位已经为劳动者垫付了该部分费用，并且有充分证据证明这一点，那么用人单位在特定情况下是有权向劳动者追偿的。建议您在处理此类问题时，先与劳动者进行沟通协商，尽量通过友好方式解决争议；如果无法协商解决，再考虑通过法律途径维护自身权益。同时，也建议您加强内部管理，确保社保和公积金的缴纳工作准确无误，以避免不必要的法律纠纷。