结论：保证人没当面在借据上签字，而是在合同上进行电子签字，其有效性需根据具体情况判断，若电子签名符合法定形式要件，且能证明是保证人本人所签，则电子签字有效；反之，则可能无效。以下从多个角度进行详细分析：

一、电子签名的法律效力

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国电子签名法》的相关规定，电子签名是指数据电文中以电子形式所含、所附用于识别签名人身份并表明签名人认可其中内容的数据。可靠的电子签名与手写签名或者盖章具有同等的法律效力。

2. 可靠电子签名的条件：

   • 电子签名制作数据用于电子签名时，属于电子签名人专有；
   • 签署时电子签名制作数据仅由电子签名人控制；
   • 签署后对电子签名的任何改动能够被发现；
   • 签署后对数据电文内容和形式的任何改动能够被发现。

二、保证人电子签字的有效性判断

1. 形式要件：

   • 若保证人的电子签名符合上述可靠电子签名的条件，且借据或合同中明确约定了电子签名的效力，则该电子签字在形式上是有效的。

2. 实质要件：

   • 除了形式要件外，还需证明该电子签名确实是保证人本人所签。这通常需要通过技术手段（如数字证书、时间戳等）来验证电子签名的真实性和完整性。
   • 若无法证明电子签名是保证人本人所签，或者存在伪造、篡改等情形，则该电子签字在实质上可能是无效的。

三、实际操作中的建议

1. 保留证据：

   • 在进行电子签名时，应确保有完整的技术记录和证据链，以证明电子签名的真实性和完整性。
   • 可以考虑使用第三方电子签名服务平台，这些平台通常提供更可靠的技术保障和证据留存服务。

2. 明确约定：

   • 在借据或合同中明确约定电子签名的效力，以及双方对电子签名的认可和接受程度。
   • 可以约定在发生争议时，以电子签名平台提供的证据作为认定事实的依据。

3. 法律咨询：

   • 在涉及重要合同或债务债权关系时，建议咨询专业律师，以确保电子签名的合法性和有效性。
   • 律师可以根据具体情况提供针对性的法律建议和风险防范措施。

四、可能的风险和后果

1. 无效风险：

   • 若电子签名不符合法定形式要件或无法证明是保证人本人所签，则该电子签字可能被认定为无效。
   • 这可能导致保证人不需要承担保证责任，从而给债权人带来损失。

2. 争议解决：

   • 在发生争议时，若电子签名的有效性成为争议焦点，则可能需要通过司法鉴定或技术手段来验证电子签名的真实性和完整性。
   • 这可能增加争议解决的成本和时间。

总结与建议：保证人没当面在借据上签字，而是在合同上进行电子签字，其有效性需根据具体情况判断。为了确保电子签名的合法性和有效性，建议在进行电子签名时保留完整的技术记录和证据链，并在借据或合同中明确约定电子签名的效力。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。