在挂靠公司施工中，因被挂靠方付款未按时造成的损失，其承担主体需根据具体情况来判定，但通常情况下，被挂靠方可能需要承担相应的责任。以下是从不同角度进行的分析：

一、合同相对性原则

1. 挂靠协议：挂靠方与被挂靠方之间通常会签订挂靠协议，明确双方的权利和义务。如果挂靠协议中明确规定了被挂靠方在付款方面的责任，以及因付款未按时造成损失时的赔偿方式，那么应当按照协议约定来执行。
2. 施工合同：挂靠方以被挂靠方的名义与第三方（如发包方）签订施工合同。在这种情况下，施工合同的相对方是被挂靠方和第三方。如果因被挂靠方付款未按时给挂靠方造成损失，这通常不直接涉及施工合同的履行问题，但可能间接影响挂靠方与被挂靠方之间的内部结算和责任划分。

二、过错责任原则

1. 被挂靠方的过错：如果被挂靠方在付款过程中存在过错，如故意拖延付款、未按照约定时间付款等，导致挂靠方遭受损失，那么被挂靠方应当承担相应的赔偿责任。
2. 挂靠方的损失：挂靠方需要证明其因被挂靠方的付款未按时而遭受了实际损失，如资金占用成本、利息损失、因延误工期而产生的额外费用等。

三、实际案例与司法实践

1. 司法判例：在司法实践中，法院通常会根据挂靠协议的具体内容、双方的实际行为以及过错程度等因素，来判定被挂靠方是否应承担赔偿责任。如果被挂靠方确实存在过错，且该过错与挂靠方的损失之间存在因果关系，那么法院可能会支持挂靠方的赔偿请求。
2. 行业惯例：在建设工程领域，挂靠行为虽然普遍存在，但并不被法律所鼓励。因此，在处理挂靠施工中的纠纷时，法院可能会更加注重保护实际施工人的利益，同时也会对被挂靠方的违法行为进行制裁。

四、法律建议

1. 完善挂靠协议：挂靠方与被挂靠方在签订挂靠协议时，应明确约定付款方式、时间以及因付款未按时造成损失时的赔偿方式等条款，以减少纠纷的发生。
2. 保留证据：挂靠方在施工过程中，应妥善保留与付款相关的证据，如付款申请、银行转账记录、沟通记录等，以便在发生纠纷时能够证明自己的损失和被挂靠方的过错。
3. 及时沟通协商：如果发生付款未按时的情况，挂靠方应及时与被挂靠方进行沟通协商，寻求解决方案。如果协商无果，可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。

总结来说，在挂靠公司施工中，因被挂靠方付款未按时造成的损失，其承担主体需根据挂靠协议的具体内容、双方的实际行为以及过错程度等因素来判定。如果被挂靠方确实存在过错，且该过错与挂靠方的损失之间存在因果关系，那么被挂靠方应当承担相应的赔偿责任。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。