总公司变更分公司负责人，若负责人不配合验证，可采取以下措施：

1. 明确法律程序与责任

   • 法律程序：总公司变更分公司负责人，需遵循《公司法》及工商行政管理部门的相关规定。这通常包括内部决策（如董事会决议）、准备并提交变更申请文件（如《分公司登记申请书》、任命文件等）、工商审核与批准等步骤。
   • 负责人责任：分公司负责人作为公司管理人员，有义务配合总公司的合法管理行为，包括变更过程中的验证等。若负责人不配合，可能构成对公司管理秩序的违反，总公司有权依据公司章程或相关法律规定采取相应措施。

2. 采取内部管理措施

   • 沟通协商：首先，总公司应尝试与分公司负责人进行沟通，了解其不配合的具体原因，并寻求解决方案。这有助于维护公司内部的和谐与稳定，同时避免不必要的法律纠纷。
   • 内部纪律处分：若沟通无果，总公司可根据公司章程或内部管理制度，对分公司负责人进行纪律处分，如警告、罚款、降职或解雇等。这些措施应依法依规进行，确保程序公正、透明。

3. 寻求法律救济

   • 提起诉讼：若分公司负责人的不配合行为给总公司造成了实际损失，或严重违反了公司章程或法律规定，总公司有权向法院提起诉讼，要求负责人承担相应的法律责任。这包括赔偿损失、恢复名誉等。
   • 申请强制执行：在获得法院判决后，若分公司负责人仍不履行义务，总公司可申请法院强制执行，以确保判决的有效执行。

4. 工商变更登记的特别处理

   • 提交必要文件：尽管分公司负责人不配合验证，但总公司仍需按照工商行政管理部门的要求，准备并提交变更申请文件。这包括任命文件、新任负责人身份证件复印件等。
   • 说明情况：在提交申请时，总公司可向工商行政管理部门说明分公司负责人不配合验证的情况，并提供相关证据（如沟通记录、内部纪律处分决定等）。工商行政管理部门将根据实际情况进行审核，并作出相应处理。

5. 预防与应对策略

   • 完善公司章程：总公司可在公司章程中明确分公司负责人的职责、义务及变更程序，以便在发生类似情况时有所依据。
   • 加强内部管理：通过加强内部管理、提高员工法律意识等方式，预防分公司负责人不配合验证等类似情况的发生。
   • 建立应急机制：针对可能出现的分公司负责人不配合验证等情况，总公司可建立应急机制，明确应对措施和责任分工，以确保公司运营的稳定性和连续性。

总结与建议： 总公司变更分公司负责人时，若遇到负责人不配合验证的情况，应首先尝试沟通协商，了解原因并寻求解决方案。若沟通无果，可采取内部管理措施或寻求法律救济。同时，总公司应完善公司章程、加强内部管理并建立应急机制，以预防类似情况的发生。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。