当公安机关已经立案但证据不足时，处理方式会因案件所处的具体诉讼阶段而有所不同。以下是从不同诉讼阶段出发的详细分析：
一、侦查阶段
继续侦查：
- 公安机关在立案后，若发现证据不足，有责任通过合法的侦查手段进一步收集证据。这包括但不限于询问证人、讯问犯罪嫌疑人、进行现场勘查、技术鉴定等，旨在构建完整、准确的证据链。
- 举例：在盗窃案件中，警方可能会进一步扩大调查范围，调取周边监控视频，走访更多目击者，以获取关键的作案证据。
变更强制措施：
- 在证据不足但又有一定犯罪嫌疑的情况下，如果犯罪嫌疑人符合取保候审或监视居住的条件，公安机关可以决定对其采取这两种非羁押性的强制措施，既保障了诉讼程序的顺利进行，又避免了不必要的羁押。
撤销案件：
- 若经过深入侦查，仍无法收集到足够的证据证明犯罪嫌疑人实施了犯罪行为，公安机关应当撤销案件。
- 法律依据：《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百六十三条，在侦查过程中，发现不应对犯罪嫌疑人追究刑事责任的，应当撤销案件；犯罪嫌疑人已被逮捕的，应当立即释放，发给释放证明，并且通知原批准逮捕的人民检察院。
二、审查起诉阶段
补充侦查：
- 人民检察院在审查案件时，如认为需要补充侦查，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。补充侦查以二次为限。
- 法律依据：《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百七十五条第二款及第三款，人民检察院审查案件，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。对于补充侦查的案件，应当在一个月以内补充侦查完毕。补充侦查以二次为限。
不起诉决定：
- 经过两次补充侦查后，若人民检察院仍认为证据不足，不符合起诉条件，应当作出不起诉决定。
- 法律依据：《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百七十七条第一款，犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者有本法第十六条规定的情形之一的，人民检察院应当作出不起诉决定。
三、审判阶段
- 无罪判决：
- 若法庭审理过程中，证据不足，不能认定被告人有罪，应当作出证据不足、指控的犯罪不能成立的无罪判决。
- 法律依据：虽然《中华人民共和国刑事诉讼法》未直接规定“证据不足无罪判决”的具体条款，但根据该法的相关规定及精神，特别是关于无罪判决的原则，可以推导出此结论。
四、综合建议
对于犯罪嫌疑人/被告人：
- 在证据不足的情况下，应积极配合公安机关或检察机关的调查工作，同时有权要求保障自己的合法权益，如申请取保候审、监视居住等。
- 若案件进入审判阶段，应充分利用庭审机会，向法庭充分陈述自己的无罪或罪轻情节，争取无罪判决或减轻处罚。
对于被害人/家属：
- 若认为公安机关或检察机关的处理不当，可以向上一级机关申诉或请求检察机关进行法律监督。
- 在案件进入审判阶段后，可以积极参与庭审活动，向法庭提供有利于自己的证据和线索，争取维护自己的合法权益。
对于所有当事人：
- 在整个诉讼过程中，都应保持与律师的紧密沟通，及时了解案件进展和下一步打算。
- 严格遵守法律程序，确保所有诉讼活动符合规定，避免因程序违法而影响案件结果。
总之，当公安机关已经立案但证据不足时，处理方式会因案件所处的具体诉讼阶段而有所不同。作为当事人或家属，应积极了解相关法律规定和程序要求，及时咨询专业律师（即我本人，邹洁律师，专注于经济纠纷、离婚财产纠纷、合同纠纷、行政复议、医疗纠纷、法律顾问、医疗事故鉴定领域），以便更好地维护自己的合法权益。