刑事案件被退回补充侦查两次，通常意味着案件在证据、事实或法律适用上存在较为显著的问题，这可能会对案件的走向和处理产生重要影响。以下是对此情况的详细分析：

1. 证据角度：

   • 证据不足：最常见的原因是现有证据无法达到起诉所要求的确实、充分标准。例如，在盗窃案件中，若仅有现场脚印而无其他直接证据，检察机关可能因证据链条不完整而退回补充侦查。若经一次补充后仍无法获取足够证据，如未找到作案工具或无相关证人证实，就可能出现第二次退查，以进一步完善证据体系。
   • 证据存在疑问或矛盾：案件中的证据可能存在冲突，或者对某些证据的真实性、关联性、合法性存疑。通过退查，要求侦查机关核实、补正或重新收集这些有问题的证据，以确保其质量和证明力。

2. 法律适用角度：

   • 在复杂案件中，涉及多个罪名认定或罪名界限模糊时，检察机关可能对最初认定的罪名有不同看法。通过退查，让侦查机关围绕不同罪名的构成要件进一步收集证据，以便准确适用法律罪名。例如，在经济犯罪案件中，对于是合同诈骗罪还是民事欺诈行为，可能需要进一步查明多方面因素来准确认定。

3. 案件程序角度：

   • 如果侦查过程中存在程序违法或不规范的情况，可能影响案件的公正性和证据的合法性。退查可以要求侦查机关对这些程序问题进行补正或作出合理解释。第二次退查可能是因为第一次补正未达到要求或又发现了新的程序问题。

4. 补充侦查的限制与法律后果：

   • 补充侦查次数限制：根据《刑事诉讼法》的规定，补充侦查的次数不得超过两次。这是法律对侦查效率和质量的明确要求。
   • 法律后果：若经过两次补充侦查后，检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件，将依法作出不起诉决定。这意味着案件不会进入审判阶段，犯罪嫌疑人可能被释放或采取其他非羁押性强制措施。

5. 对案件的整体影响：

   • 退侦两次对案件的影响显著，它可能导致案件无法被起诉，从而无法对犯罪嫌疑人进行刑事追责。这不仅给公安机关和检察院带来了更大的工作压力和时间成本，也要求他们更加严谨、细致地搜集证据和查清事实。

总结与建议：

刑事案件被退回补充侦查两次，通常是因为案件在证据、事实或法律适用上存在重大问题。这要求侦查机关和检察机关必须更加谨慎地处理案件，确保每一个决定都基于充分、确凿的证据和正确的法律适用。对于犯罪嫌疑人及其家属而言，这可能意味着案件的处理时间会延长，且存在不起诉的可能性。因此，建议犯罪嫌疑人及其家属保持耐心，并密切关注案件的进展。同时，如有需要，可以及时向我咨询，我会根据案件的具体情况提供专业的法律意见和帮助。