关于您提出的“工资协议包括五险一金是否合法”的问题，这并非一个简单的“合法”或“不合法”的判断，而是需要依据劳动合同的具体约定以及相关法律法规来综合考量。以下是我为您提供的详细解答：
一、工资协议与五险一金的关系
工资协议，即劳动合同中关于工资的条款，它是否包含五险一金，主要取决于劳动合同中的具体约定。如果合同中明确写明了工资包含五险一金，那么该工资数额就是包含了企业和个人应承担的五险一金部分的总额。这种约定是合法的，只要它符合相关法律法规的规定，并且双方当事人在签订合同时都是自愿、平等、公平的。
二、法律层面的分析
应发工资与实发工资：
- 应发工资：通常指的是税前且未扣除五险一金等费用的工资总额。
- 实发工资：则是应发工资扣除个人缴纳的五险一金、个人所得税等之后的净额。
五险一金的缴纳：
- 五险一金（养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险、生育保险和住房公积金）的缴纳是法定的，企业和个人都有相应的缴纳义务。
- 五险一金的缴纳基数通常是以工资总额为基准，但这并不意味着工资本身就包含了五险一金。
合同约定的合法性：
- 如果劳动合同中明确约定工资包含五险一金，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么这种约定是合法的。
- 如果合同中没有明确约定，或者约定不明确，那么通常按照法律法规和惯例来处理，即工资不包含五险一金，企业需额外为员工缴纳企业应承担的部分。
三、实际操作建议
明确约定：
- 在签订劳动合同时，建议双方明确约定工资是否包含五险一金，以避免后续产生不必要的争议。
- 约定应具体、明确，避免使用模糊或歧义的表述。
了解法律法规：
- 双方应了解并遵守相关法律法规关于工资和五险一金的规定，确保合同的合法性和有效性。
咨询专业人士：
- 如果对合同约定或相关法律法规有疑问，建议咨询专业的法律人士或机构，以获得准确的解答和指导。
综上所述，工资协议包括五险一金是否合法，主要取决于劳动合同中的具体约定以及相关法律法规的规定。在签订劳动合同时，双方应明确约定工资是否包含五险一金，并了解相关法律法规，以确保合同的合法性和有效性。