学生偷学校超市东西且金额过大的处理方式需分情况讨论，具体如下：
学校内部处理层面
学校作为教育机构，首先会依据校规校纪进行处分。根据《普通高等学校学生管理规定》第五十二条，学生有“触犯国家法律，构成刑事犯罪”或“受到治安管理处罚，情节严重、性质恶劣”的情形，学校可给予开除学籍处分。若盗窃金额达到当地盗窃罪的立案标准（如多数地区为2000元以上），学校可能直接移交公安机关处理；若未达刑事标准但属治安违法（如金额较大但未达刑事立案标准），学校可能先进行纪律处分（如记过、留校察看），同时配合公安机关调查。
法律责任层面
- 刑事责任：若盗窃金额达到当地盗窃罪的立案标准，学生可能面临《刑法》第二百六十四条的处罚。根据金额大小，可能被判处三年以下有期徒刑、拘役或管制，并处或单处罚金；若金额特别巨大或存在其他严重情节（如多次盗窃、入室盗窃等），刑罚可能更重。
- 治安责任：若金额未达刑事标准但属于治安违法，根据《治安管理处罚法》第四十九条，学生可能被处五日以上十日以下拘留，可以并处五百元以下罚款；情节较重的（如多次盗窃、结伙盗窃等），处十日以上十五日以下拘留，可以并处一千元以下罚款。但需注意，已满14周岁不满18周岁的学生初次违反治安管理的，不执行行政拘留处罚。
民事赔偿层面
无论是否承担刑事或治安责任，学生均需根据《民法典》第一千一百八十四条承担民事赔偿责任，即赔偿超市因盗窃行为遭受的实际损失（如被盗物品价值、因盗窃导致的营业损失等）。若学生为未成年人，其监护人需承担赔偿责任。
特殊情形处理
- 年龄因素：若学生未满16周岁，一般不承担刑事责任（但已满14周岁不满16周岁的人犯故意杀人、故意伤害致人重伤或死亡、强奸、抢劫、贩卖毒品、放火、爆炸、投放危险物质罪的除外），但需承担治安责任（不执行拘留）和民事赔偿责任；若已满16周岁，则需承担完全刑事责任。
- 主动退赃与认罪态度：若学生主动退赃、认罪认罚，可能从轻或减轻处罚。例如，在刑事案件中，根据《刑法》第六十七条，自首可减轻处罚；在治安案件中，主动消除或减轻违法后果并取得被侵害人谅解的，可减轻处罚或不予处罚。
建议：若涉及此类事件，学生或家长应第一时间配合学校及公安机关调查，主动退赃并表达悔过态度，以争取从宽处理。若对法律程序或责任认定有疑问，可直接向我咨询，我会结合具体金额、地区标准及学生年龄等细节进一步分析。