若您因相邻权纠纷起诉对方且对方是房主，您可以按照以下步骤处理，房主身份不影响法律程序和权利主张：

1. 明确相邻权纠纷类型及法律依据
   相邻权纠纷通常涉及通风、采光、排水、噪音、管线铺设等相邻不动产权利人之间的权利义务关系。根据《民法典》第288条至第296条，不动产的相邻权利人应当按照有利生产、方便生活、团结互助、公平合理的原则处理相邻关系。例如：

   • 若对方房主在装修时破坏了您的房屋结构（如拆除承重墙），可依据《民法典》第272条主张其停止侵害、恢复原状；
     
   • 若对方房主长期排放噪音或异味影响您的正常生活，可依据《民法典》第294条要求其排除妨碍、赔偿损失。
     关键点：无论对方是房主还是租客，只要其行为侵犯了您的相邻权，您均有权起诉。

2. 收集证据并固定事实
   证据是胜诉的关键，需围绕“侵权行为存在”“损害结果发生”“侵权行为与损害结果之间的因果关系”展开：

   • 现场证据：拍照、录像记录对方侵权行为（如乱堆杂物、违规搭建、噪音超标等），注意保留原始载体；
     
   • 书面证据：物业出具的整改通知、居委会调解记录、报警回执等；
     
   • 证人证言：邻居或物业工作人员的书面证言；
     
   • 专业鉴定：如涉及房屋安全、噪音分贝等，可委托专业机构出具鉴定报告。
     提示：若对方是房主，其抗辩理由可能包括“不知情”“已委托他人管理”等，但这些均不构成免责事由，您仍可主张其作为所有权人承担责任。

3. 起诉流程及房主身份的应对

   • 确定被告：以房主为被告，若房屋实际由他人使用（如租客），可将其列为共同被告或第三人，但需证明其与侵权行为有关；
     
   • 管辖法院：向房屋所在地基层人民法院提起诉讼；
     
   • 诉讼请求：明确要求对方停止侵害、排除妨碍、赔偿损失等，并附具体金额及计算依据；
     
   • 送达与答辩：法院会向房主送达起诉状副本，其需在15日内提交答辩状。若房主拒不签收，可公告送达；
     
   • 庭审与判决：法院将根据证据和法律规定判决，若房主不履行判决，可申请强制执行。
     注意：房主可能以“房屋已出租”“不知情”等抗辩，但根据《民法典》第1165条，行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应承担侵权责任，房主作为所有权人无法以此免责。

4. 调解与诉讼的平衡
   若房主愿意协商，可优先通过物业、居委会或法院调解解决，既能节省时间成本，也能维护邻里关系。但若调解无果或对方态度恶劣，应果断起诉，避免损害扩大。

总结：相邻权纠纷中，对方是否为房主不影响您的起诉权利，关键在于固定证据、明确法律依据并依法主张权利。若需进一步分析具体案情或协助起草法律文书，可随时向我咨询。