自愿辞职与自动离职在工龄认定上存在明显区别，具体如下：
自愿辞职是指劳动者基于个人原因，主动向用人单位提出解除劳动合同的行为。在工龄认定上，自愿辞职通常不会影响劳动者已获得的工龄。也就是说，劳动者在辞职前的工作年限，仍然会被计入其总工龄之中。这是因为工龄的计算是基于劳动者实际提供劳动的时间，而自愿辞职并不改变劳动者已经为用人单位工作过的事实。
自动离职则是指劳动者未经用人单位同意，擅自离开工作岗位的行为。这种行为在工龄认定上可能会产生不同的后果，具体取决于用人单位的规定以及相关法律法规的适用。
若用人单位有明确规定：如果用人单位在规章制度中明确规定了自动离职的处理方式，包括是否计发工资、是否扣除工龄等，那么这些规定将作为处理自动离职工龄认定的依据。如果规定中明确指出自动离职将扣除部分或全部工龄，那么劳动者在自动离职后，其工龄可能会受到相应影响。
若法律法规有特别规定：在某些特定情况下，法律法规可能对自动离职的工龄认定有特别规定。例如，如果劳动者自动离职是因为用人单位存在违法行为（如拖欠工资、未提供劳动保护等），那么劳动者在主张权益时，其工龄可能会得到特殊保护，不受自动离职行为的影响。
一般原则下的工龄认定：在缺乏明确规定或法律法规特别指导的情况下，自动离职通常不会直接导致工龄的扣除。然而，由于自动离职可能引发劳动合同的解除，劳动者在寻找新工作时，其自动离职的经历可能会对新用人单位对其工龄的认定产生一定影响。这种影响更多是基于新用人单位的自主判断，而非法律上的直接规定。
总结与建议：
自愿辞职通常不会影响劳动者的工龄认定，而自动离职的工龄认定则可能因用人单位规定或法律法规的适用而有所不同。因此，建议劳动者在考虑离职时，应充分了解用人单位的相关规定和法律法规的适用情况，以避免因离职方式不当而影响自己的工龄认定和权益保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。