在非法用工单位伤亡一次性赔偿中，医疗费是不应被公司扣除的，而是应由所在单位全额支付。以下是详细分析：
赔偿内容与标准：
- 根据《非法用工单位伤亡人员一次性赔偿办法》的相关规定，一次性赔偿包括治疗期间费用和一次性赔偿金。其中，治疗期间费用就涵盖了医疗费、生活费、护理费、住院伙食补助费以及交通费等。这些费用都是按照《工伤保险条例》的规定执行，并由所在单位支付。
- 一次性赔偿金的数额则是根据伤残等级或死亡情况来确定的，伤残等级越高，赔偿金倍数越高。赔偿基数为单位所在工伤保险统筹地区上年度职工年平均工资。
医疗费支付原则：
- 在非法用工的情况下，由于单位未依法进行登记或备案，或者已被吊销营业执照、撤销登记备案，因此无法享受工伤保险待遇。但这并不意味着伤亡职工或童工的医疗费等费用就可以被扣除或不予支付。
- 相反，根据相关法律法规，非法用工单位应承担全部的治疗期间费用，包括医疗费。这是为了保障伤亡职工或童工的基本医疗需求，确保他们能够得到及时有效的治疗。
法律后果与争议处理：
- 如果单位拒不支付一次性赔偿，包括医疗费等治疗期间费用，伤亡职工或童工的近亲属可以向人力资源和社会保障行政部门举报。经查证属实后，行政部门将责令单位限期改正，并可能对其进行相应的处罚。
- 如果就赔偿数额与单位发生争议，可以按照处理劳动争议的有关规定进行处理。这通常包括协商、调解、仲裁和诉讼等程序，以确保伤亡职工或童工的合法权益得到维护。
建议与提醒：
- 对于非法用工单位的伤亡职工或童工及其近亲属来说，了解并维护自己的合法权益至关重要。在遭遇非法用工和伤亡情况时，应及时收集相关证据，如医疗记录、工作证明等，以便在后续的赔偿和争议处理中占据有利地位。
- 如果对赔偿标准、程序或法律后果等方面存在疑问或不确定，建议直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律解释和专业的法律建议。