结论：公司调休星期日上班却按星期五上班工资支付，这种做法一般是不合法的。具体是否合法，需结合劳动合同、公司规章制度以及相关法律法规来综合判断。
分析说明：
法律法规依据：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，应支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。这意味着，如果星期日是员工的休息日，且公司未安排补休，那么公司应支付双倍工资。
- 若公司调休导致星期日成为工作日，但按照星期五的工资标准支付，这实际上可能违反了上述规定，因为星期日作为休息日（在调休前）应享有更高的工资报酬（如果未补休）。然而，如果调休是合法的，并且公司已经通过其他方式（如安排其他休息日）进行了补偿，那么情况可能有所不同。但关键在于，调休不能简单地改变休息日应享有的工资报酬标准。
劳动合同与规章制度：
- 劳动合同和公司规章制度是判断公司行为是否合法的重要依据。如果劳动合同或规章制度中明确规定了调休时工资的支付方式，并且这种方式不违反法律法规，那么公司可能按照该规定执行。
- 但如果劳动合同或规章制度中未明确规定，或者规定与法律法规相冲突，那么公司应按照法律法规的规定支付工资。
实际操作中的合法性判断：
- 在实际操作中，判断公司行为是否合法，需要综合考虑多个因素，包括调休的合法性、是否安排了补休、工资支付标准是否符合法律法规等。
- 如果公司未经员工同意擅自调休，并且未按照法律法规的规定支付工资，那么这种行为很可能是违法的。
法律建议：
- 员工角度：如果你认为公司的调休和工资支付方式不合法，你可以先与公司进行沟通协商，要求公司按照法律法规的规定支付工资。如果协商无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 公司角度：公司应确保调休的合法性，并明确告知员工调休期间的工资支付标准。如果调休导致员工休息日发生变化，公司应考虑通过其他方式（如安排补休或支付加班费）来保障员工的合法权益。
可能后果：
- 如果公司行为被认定为违法，公司可能需要支付拖欠的工资、加班费以及可能的赔偿金。同时，公司还可能面临劳动监察部门的处罚和声誉损失。
示例说明：
假设某公司未经员工同意，擅自将星期日调休为工作日，并按照星期五的工资标准支付工资。如果员工在星期日工作了8小时，且公司未安排补休，那么根据《中华人民共和国劳动法》的规定，公司应支付员工不低于正常工资两倍的报酬。如果公司只支付了星期五的工资标准，那么公司就违反了法律法规的规定。
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