结论前置：股权转让协议中，转钱备注为“押金”的合法性需结合具体情境分析，一般情况下，若双方约定明确且符合法律规定，该备注是合法的；但若存在欺诈、隐瞒等情形，则可能不合法。以下从不同角度详细分析：
一、合法性分析
双方约定明确：
- 在股权转让协议中，双方可以就转让款项的支付方式、时间、金额及备注等进行明确约定。若双方约定将部分款项作为“押金”，并在协议中明确该押金的性质、用途、退还条件等，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么转钱时备注为“押金”是合法的。
符合法律规定：
- 押金作为一种担保方式，在法律上是被允许的。只要双方约定的押金条款不违反《民法典》等相关法律法规的规定，如不设定过高的押金比例、不违反公平原则等，那么该备注就是合法的。
二、可能存在的风险及不合法情形
欺诈或隐瞒：
- 若转让方以“押金”为名，实际意图是骗取受让方的钱财，或者隐瞒了股权的真实状况（如存在纠纷、抵押等），导致受让方在不知情的情况下支付了“押金”，那么这种行为可能构成欺诈，是不合法的。
违反法律法规：
- 若双方约定的押金条款违反了法律法规的强制性规定，如设定了过高的押金比例、违反了公平原则或损害了第三方的利益等，那么该备注可能因违反法律规定而被认定为不合法。
备注与协议内容不符：
- 若股权转让协议中并未提及“押金”或相关条款，但转让方在转钱时擅自备注为“押金”，这可能导致双方对款项性质产生争议。在这种情况下，若无法证明双方就“押金”达成了一致意见，那么该备注可能因缺乏合同依据而不被认可。
三、法律建议
明确约定：
- 在签订股权转让协议时，双方应就转让款项的支付方式、时间、金额及备注等进行明确约定，并确保约定内容符合法律法规的规定。若涉及“押金”，应在协议中明确其性质、用途、退还条件等。
保留证据：
- 双方应妥善保管与股权转让相关的所有证据，包括协议、转账记录、备注信息等。这些证据在发生争议时将起到至关重要的作用。
及时咨询：
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举例说明：假设甲和乙签订了一份股权转让协议，约定甲将持有的某公司股权转让给乙，转让款项为100万元，其中5万元作为押金，用于担保股权转让过程中可能产生的纠纷或违约情况。若双方在协议中明确约定了押金的性质、用途和退还条件，且该约定符合法律法规的规定，那么乙在支付款项时备注为“押金”是合法的。