公司只扣个税而不交社保是不合法的。下面我为您详细解析这个问题：
一、法律依据与义务
社保缴纳强制义务：
- 根据《中华人民共和国社会保险法》第五十八条，用人单位自用工之日起三十日内需为职工向社会保险经办机构申请办理社会保险登记。这意味着公司必须为员工缴纳社保，且此义务是强制性的。
- 若公司未履行此义务，依据该法第八十四条，社会保险行政部门将责令限期改正，逾期不改正的，可能面临应缴社会保险费数额一倍至三倍的罚款，对直接负责的主管人员和其他直接责任人员也可能处以个人罚款。
个税代扣代缴义务：
- 依据《中华人民共和国个人所得税法》，公司作为扣缴义务人，有义务在个人所得达到纳税标准时代扣代缴个人所得税。
- 但个税的缴纳与社保的缴纳是两个独立的法律义务，不能相互替代。
二、对劳动者的影响
公司不交社保会对劳动者造成多方面的负面影响：
- 社会保障缺失：劳动者将失去养老保险、医疗保险、生育保险、失业保险和工伤保险等社会保障，这将直接影响其退休后的养老金待遇、医疗报销权益、生育津贴、失业保障以及工伤赔偿等。
- 生活质量与发展机会受限：社保缴纳情况通常与购房、购车、子女教育、落户等政策相关联，不交社保可能影响劳动者的这些生活质量和发展机会。
三、劳动者的维权途径
面对公司不交社保的情况，劳动者可以采取以下措施来维护自己的权益：
- 初步协商：首先尝试与公司进行沟通，明确指出缴纳社保的法定义务，并要求公司及时补缴。
- 正式投诉：若协商无果，劳动者可以向当地社保经办机构或劳动监察部门投诉举报。相关部门将对此进行调查，并责令公司改正，必要时对公司进行处罚。
- 法律仲裁与诉讼：作为更进一步的措施，劳动者可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司补缴社保并赔偿损失。对仲裁结果不满的，还可以向人民法院提起诉讼，通过司法程序来维护自己的权益。
综上所述，公司只扣个税而不交社保是不合法的。劳动者应了解自己的法律权益，并通过合法途径积极维权，确保自己的社会保障得到落实。同时，也建议公司在遵守法律的基础上，完善员工福利制度，以构建和谐的劳动关系。