结论：员工请了6个月以上病假，年度考核等次是否可以是不合格，这并非一个绝对的问题，而是需要根据具体情况来判断，包括公司的规章制度、劳动合同的约定以及病假员工的实际工作表现等因素。

分析：

1. 公司规章制度与劳动合同的约定：

   • 首先，需要查阅公司的规章制度和劳动合同中是否有关于病假期间考核的具体规定。如果规章制度或劳动合同中明确规定了病假期间不参与考核或考核等次不受影响，那么公司就不能单方面将员工的年度考核等次定为不合格。
   • 如果规章制度或劳动合同中没有明确规定，那么公司需要根据实际情况和公平原则来制定合理的考核标准。

2. 病假员工的实际工作表现：

   • 即使员工请了长期病假，但如果其在病假期间能够通过远程工作、提交工作报告等方式保持一定的工作表现，且这些表现符合公司的考核标准，那么公司就不应将其年度考核等次定为不合格。
   • 如果员工因病假确实无法履行工作职责，且没有通过其他方式弥补工作缺失，那么公司可以根据实际情况和规章制度，对其年度考核等次进行合理调整。但调整时需注意，应确保考核的公正性和合理性，避免对员工造成不公平的待遇。

3. 法律法规的遵循：

   • 公司在制定和执行考核制度时，必须遵循相关的法律法规，如《劳动法》、《劳动合同法》等。这些法律法规保护员工的合法权益，禁止公司对员工进行不公平的考核或处罚。
   • 如果公司违反法律法规，将员工的年度考核等次定为不合格，并因此采取不合理的处罚措施（如降薪、解雇等），员工有权向劳动仲裁机构或法院提起申诉，维护自己的合法权益。

建议：

• 对于公司而言，应制定完善的规章制度和劳动合同，明确病假期间的考核标准和程序，确保考核的公正性和合理性。同时，在执行考核制度时，应充分考虑员工的实际情况和法律法规的要求，避免对员工造成不公平的待遇。
• 对于员工而言，如果因病假导致年度考核等次可能不合格，应积极与公司沟通，说明自己的实际情况和困难，争取公司的理解和支持。如果公司坚持不合理考核，员工可以向劳动仲裁机构或法院提起申诉，维护自己的合法权益。

可能后果：

• 如果公司不合理地将病假员工的年度考核等次定为不合格，并因此采取不合理的处罚措施，可能面临劳动仲裁机构的裁决或法院的判决，要求公司撤销不合理的考核结果和处罚措施，并可能承担相应的赔偿责任。
• 对于员工而言，如果因病假导致年度考核等次不合格，但公司未采取不合理的处罚措施，员工应理解公司的决定，并积极配合公司的工作安排，争取在未来的工作中表现更好。