发生小事故后双方未达成赔偿协议，交警会按照以下程序处理：

1. 现场勘查与责任认定
   交警到达现场后，会首先进行勘查，包括拍照、测量、询问当事人及目击者等，固定事故证据。随后根据《道路交通安全法实施条例》第九十一条，结合双方行为对事故的作用及过错程度，在10日内出具《交通事故责任认定书》，明确双方责任比例（如全责、主次责、同等责等）。这是后续处理的核心依据。

2. 组织调解（可选程序）
   若双方同意，交警可依据《道路交通事故处理程序规定》第八十四条，在责任认定后3日内组织调解。调解内容通常包括赔偿项目（如医疗费、误工费、车辆维修费等）及金额。调解成功会制作《调解协议书》，双方签字后具有法律效力；若调解失败或一方拒绝调解，交警会终止调解并告知当事人通过诉讼解决。

3. 对违法行为的处罚
   若事故中存在交通违法行为（如超速、酒驾、未让行等），交警会依据《道路交通安全法》单独作出行政处罚（如罚款、扣分、暂扣驾照等），与赔偿问题分开处理。例如，一方因酒驾被认定全责，既需承担全部赔偿，还会面临吊销驾照等处罚。

4. 告知后续救济途径
   调解失败或未参与调解的，交警会向双方出具《事故处理通知书》，明确告知：

   • 可向法院提起民事诉讼要求赔偿；
     
   • 若对责任认定不服，可在3日内申请复核（但复核不影响诉讼程序）；
     
   • 涉及人身伤害的，需在1年内起诉（诉讼时效从知道权益受损之日起算）。

关键提醒：

• 即使对责任认定有异议，也建议先签收认定书（不签收不影响效力），再通过复核或诉讼维权，避免因拒签被交警强制送达。
  
• 赔偿协商时，可要求对方提供身份证、驾驶证、保险单等复印件，并保留医疗票据、维修清单等证据，以防后续诉讼需要。
  

如有具体细节（如是否有人伤、责任争议点等），可进一步说明，我会结合案例为您分析应对策略。