结论：工厂转让后，若第二个老板（即新用人单位）因经营不善关门，员工是否有补偿需分情况讨论，主要取决于工厂转让的性质以及新用人单位是否依法履行了相关义务。

分析如下：

1. 工厂转让的性质：

   • 资产转让：如果工厂转让仅仅是资产的转让，如设备、厂房等，而原用人单位（即第一个老板）的法人资格并未消灭，且员工与原用人单位的劳动关系未发生变更，那么新用人单位（第二个老板）的关门行为，原则上不影响员工与原用人单位的劳动关系。此时，若原用人单位未依法解除或终止与员工的劳动关系，员工通常无权直接向新用人单位主张补偿。但若原用人单位因转让导致无法继续经营，进而依法解除或终止与员工的劳动关系，则员工有权依据《劳动合同法》的相关规定，要求原用人单位支付经济补偿。
   • 整体转让（包括业务、资产和员工）：如果工厂转让是整体转让，包括业务、资产和员工，且新用人单位承接了原用人单位的权利和义务，那么员工与新用人单位之间将建立新的劳动关系。在此情况下，若新用人单位因经营不善关门，且依法与员工解除或终止了劳动关系，员工则有权依据《劳动合同法》的相关规定，要求新用人单位支付经济补偿。

2. 经济补偿的计算：

   • 根据《劳动合同法》第四十七条的规定，经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，以每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
   • 劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。
   • 计算公式：\(经济补偿=工作年限\times月工资\)（月工资超过本地区上年度职工月平均工资三倍的，按三倍计算，且年限最高不超过十二年）。

3. 特殊情况：

   • 如果新用人单位在关门时未依法与员工解除或终止劳动关系，如未提前通知、未支付经济补偿等，员工除了有权要求支付经济补偿外，还可能有权要求支付赔偿金或要求继续履行劳动合同等。
   • 如果员工与新用人单位之间就经济补偿等事宜存在争议，且无法通过协商解决，员工可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，对仲裁裁决不服的，还可以向人民法院提起诉讼。

建议：

• 对于员工而言，在工厂转让后，应及时了解自己的劳动关系是否发生了变更，以及新用人单位是否依法履行了相关义务。
• 若新用人单位因经营不善关门，员工应保留好相关证据，如劳动合同、工资单、工作证明等，以便在主张经济补偿时使用。
• 如有任何疑问或争议，建议及时咨询专业律师（即我本人，刘天律师，专注于合同纠纷、经济纠纷、劳动纠纷领域），以维护自己的合法权益。