结论：月薪6500但加班只按2360算，这种做法很可能是违法的，具体是否违法需结合加班工资的计算基数和加班时长等因素综合判断。

分析如下：

1. 加班工资的计算基数：

   • 根据《劳动法》及相关规定，加班工资的计算基数通常应为劳动者本人的日或小时工资标准。这个基数一般不应低于劳动合同约定的劳动者本人所在岗位相对应的工资标准，也不应低于当地政府公布的最低工资标准。
   • 在您的情况下，如果劳动合同中明确约定了月薪为6500元，且没有特别说明加班工资的计算基数为2360元，那么加班工资的计算基数应为6500元（或根据合同约定的具体计算方式得出的数额），而非2360元。

2. 加班工资的计算方式：

   • 加班工资的计算通常根据加班时长和加班工资的计算基数来确定。例如，工作日加班通常按照不低于本人小时工资标准的150%支付加班工资；休息日加班且不能安排补休的，按照不低于本人日或小时工资标准的200%支付加班工资；法定节假日加班的，按照不低于本人日或小时工资标准的300%支付加班工资。
   • 如果您的加班工资是按照2360元作为基数来计算的，而实际上您的月薪是6500元，那么这种计算方式很可能导致您得到的加班工资低于法定标准。

3. 可能的法律后果：

   • 如果用人单位确实存在违法计算加班工资的行为，您有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求用人单位补发加班工资差额，并可能获得相应的经济补偿。

建议：

• 核对劳动合同：首先，请仔细核对您的劳动合同，确认其中是否明确约定了加班工资的计算基数和计算方式。
• 与用人单位沟通：如果发现加班工资的计算存在问题，您可以先与用人单位进行沟通，要求其按照法定标准支付加班工资。
• 寻求法律帮助：如果沟通无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。在此过程中，如有需要，您可以随时向我咨询相关法律问题。