中标后，招标人在有质疑的情况下不发中标通知书是违法的行为。以下从多个角度为你详细分析：

一、法律依据与中标通知书的发放要求

根据《中华人民共和国招标投标法》第四十五条的规定，中标人确定后，招标人应当向中标人发出中标通知书，并同时将中标结果通知所有未中标的投标人。这一规定明确了发放中标通知书是招标人在确定中标人后的法定义务，无论是否存在质疑，招标人都必须履行这一义务。

二、中标通知书的重要性

1. 法律效力：中标通知书对招标人和中标人均具有法律效力，是双方后续签订合同的重要依据。它标志着招投标活动的正式结束，并开启了合同签订和履行的阶段。
2. 权益保障：中标通知书不仅是告知中标结果的书面文件，更是中标人基于招投标程序信赖进行后续准备工作的法律保障。若招标人不发中标通知书，中标人可能因无法确认中标结果而遭受经济损失，如筹备资金、安排人员、预订设备材料等所投入的成本和精力。
3. 责任明确：中标通知书发出后，若招标人改变中标结果或中标人放弃中标项目，均需依法承担相应法律责任。这有助于维护招投标活动的公正性和严肃性。

三、违法行为的后果

1. 行政责任：招标人不发中标通知书将面临被相关行政监督部门责令改正、给予警告或处以罚款等行政处罚。这体现了国家对招投标活动的严格监管和对违法行为的严厉打击。
2. 民事责任：若因此给中标人造成经济损失，招标人还需依法承担赔偿责任。中标人有权要求招标人赔偿因不发中标通知书而遭受的直接和间接损失。
3. 信誉影响：此类违法行为还可能严重影响招标人的信誉和声誉，对其未来的招标活动及市场形象产生负面影响。在招投标市场中，信誉和声誉是招标人重要的无形资产，一旦受损将难以恢复。

四、中标通知书的发放时间与实践做法

虽然《中华人民共和国招标投标法》并未对中标通知书的发放时间做出具体规定，但通常实践做法是，在确定中标人后先进行为期三天的中标公示。公示期满且无异议后，招标人应及时向中标人发出中标通知书。这一做法有助于确保招投标活动的透明度和公正性，同时给未中标人提供提出异议的机会。

建议：如果你作为中标人遇到了招标人不发中标通知书的情况，你可以首先与招标人进行沟通协商，要求其履行发放中标通知书的义务。如果沟通无果，你可以向相关行政监督部门投诉举报，或者通过法律途径维护自己的合法权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。