关于行政案件中第二次司法鉴定被推翻的情况，并没有一个固定的比例或普遍规律，这主要取决于具体案件的事实、证据以及鉴定过程的专业性和公正性。不过，我可以从几个角度来分析这个问题，帮助你更好地理解。
鉴定过程的专业性和公正性：
- 如果第一次鉴定过程存在专业上的瑕疵，比如鉴定方法不科学、鉴定依据不充分，或者鉴定机构、鉴定人员不具备相应的资质，那么第二次鉴定推翻第一次鉴定的可能性就会相对较大。
- 同样，如果第一次鉴定过程中存在不公正的行为，比如受到外部干扰、利益输送等，那么第二次鉴定也很可能会对第一次鉴定的结果提出质疑并推翻。
案件事实的复杂性和证据的充分性：
- 在一些复杂的行政案件中，案件事实可能涉及多个方面，证据也可能比较繁杂。如果第一次鉴定没有全面、准确地把握案件事实和证据，那么第二次鉴定在补充了新的证据或采用了更科学的鉴定方法后，就有可能推翻第一次鉴定的结果。
- 反之，如果案件事实相对简单，证据也比较充分，且第一次鉴定过程严谨、科学，那么第二次鉴定推翻第一次鉴定的可能性就会相对较小。
鉴定标准和法律适用的变化：
- 随着科学技术的发展和法律制度的完善，鉴定标准和法律适用也可能发生变化。如果第一次鉴定依据的是旧的鉴定标准或法律适用，而第二次鉴定时新的鉴定标准或法律适用已经出台，那么第二次鉴定就有可能根据新的标准或法律适用来推翻第一次鉴定的结果。
当事人对鉴定结果的异议和申请：
- 在行政案件中，当事人对鉴定结果有异议的，可以依法申请重新鉴定。如果当事人能够提供充分的证据证明第一次鉴定存在错误或瑕疵，那么法院或行政机关就有可能批准重新鉴定，并有可能根据第二次鉴定的结果来推翻第一次鉴定的结果。
给你的建议：
- 如果你正面临一个行政案件，且对第一次司法鉴定的结果有异议，你可以考虑依法申请重新鉴定。在申请时，要尽可能提供充分的证据证明第一次鉴定存在错误或瑕疵，以增加第二次鉴定推翻第一次鉴定的可能性。
- 同时，你也要做好心理准备，因为第二次鉴定并不一定会推翻第一次鉴定的结果。这取决于具体案件的事实、证据以及鉴定过程的专业性和公正性。
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