结论：公司因交通事故请假四个月而扣除年假是否合理，需根据具体情况判断，一般情况下，若交通事故请假属于法定带薪休假范畴或符合公司规章制度中的特殊休假规定，公司扣除年假则不合理；若请假不属于法定带薪休假且公司规章制度明确规定可扣除年假，则公司行为可能合理，但需符合相关法律法规及程序要求。以下从不同角度详细分析：
一、法定带薪休假与年假的关系
根据《职工带薪年休假条例》等相关法律法规，职工在法定工作时间内享有带薪年休假的权利。年假是职工因工作而应享受的休息时间，与职工是否因个人原因（如交通事故）请假无直接关系。若交通事故请假期间，职工仍享有法定带薪休假的权利（如病假、婚假、产假等法定假期），则公司无权扣除年假。
二、公司规章制度与年假扣除
公司规章制度合法性：公司规章制度中关于年假扣除的规定，必须符合国家法律法规的要求，且经过民主程序制定并公示，方能对职工产生约束力。若公司规章制度未经合法程序制定或公示，或规定内容违反法律法规，则该规定无效，公司不得据此扣除年假。
规章制度具体内容：即使公司规章制度合法有效，也需具体分析其关于年假扣除的规定。若规章制度明确规定，因交通事故等个人原因请假超过一定期限可扣除年假，且该规定不违反法律法规的强制性规定，则公司行为可能合理。但需注意，公司规章制度不得剥夺职工法定带薪休假的权利。
三、实际操作中的建议
核实公司规章制度：首先，您应核实公司关于年假扣除的具体规章制度，确认其是否合法有效，以及是否明确规定了因交通事故请假可扣除年假的情形。
与公司沟通协商：若公司规章制度存在模糊或不合理之处，或您认为公司扣除年假的行为违反了法律法规或规章制度，建议您与公司进行沟通协商，寻求合理解决方案。
寻求法律援助：若沟通协商无果，且您认为公司行为侵犯了您的合法权益，您可以向当地劳动监察部门投诉或寻求法律援助，通过法律途径维护自己的权益。
四、特殊情况下的年假扣除
若交通事故请假期间，您确实无法享受法定带薪休假（如病假已用完且未达到享受其他法定假期的条件），且公司规章制度明确规定可扣除年假，同时该规定不违反法律法规的强制性规定，那么在这种情况下，公司扣除年假的行为可能被视为合理。但即便如此，公司也应确保扣除年假的程序合法合规，如提前通知、听取职工意见等。
最后，年假是职工的重要权益之一，公司不得随意扣除。若您因交通事故请假四个月而被公司扣除年假，且您认为该行为不合理或违法，建议您及时咨询专业律师（即我，郭成律师，专注于合同纠纷、交通事故领域），以便更好地维护自己的合法权益。