针对您提出的企业简易注销流程中遇到“有已申请未立案案件”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，需要明确的是，企业在进行简易注销时，应当确保企业不存在未结清的债权债务、未了结的诉讼或仲裁案件等可能影响注销的情形。若企业存在已申请但未立案的案件，这通常意味着企业可能涉及潜在的法律纠纷或债务问题，这可能会对企业简易注销的流程产生阻碍。

针对这种情况，我建议您采取以下步骤：

1. 了解案件情况：

   • 首先，您需要详细了解该已申请未立案案件的具体情况，包括案件的性质、涉及的金额、对方当事人的情况等。
   • 您可以联系相关法院或仲裁机构，查询案件的进展状态，确认案件是否确实未立案，以及未立案的原因。

2. 评估影响：

   • 根据案件的具体情况，评估该案件对企业注销可能产生的影响。
   • 如果案件涉及较大的金额或复杂的法律关系，可能会对企业注销产生较大的阻碍。

3. 采取相应措施：

   • 如果案件可以迅速解决：例如，通过协商、调解等方式与对方当事人达成和解，您可以尽快处理案件，确保在企业注销前了结所有法律纠纷。
   • 如果案件无法迅速解决：或者您认为案件对企业注销的影响不大（例如，案件金额较小，且您有充分的证据证明企业无需承担责任），您可以考虑在提交简易注销申请时，向登记机关如实说明案件情况，并提供相关证据材料。
   • 咨询专业律师：在处理复杂案件时，建议您咨询专业律师的意见，以确保您的决策合法合规，并最大程度地保护企业的利益。

4. 遵循简易注销流程：

   • 在处理完或评估完案件后，您可以继续按照简易注销的流程进行操作。
   • 简易注销通常需要提交《简易注销全体投资人承诺书》等材料，并确保企业符合简易注销的条件（如未发生债权债务或已将债权债务清算完结等）。

5. 关注后续进展：

   • 在提交简易注销申请后，您需要关注登记机关的审核进展。
   • 如果登记机关对案件情况提出疑问或要求补充材料，您需要及时配合并提供相关信息。

额外提醒：

• 根据《企业注销指引(2023年修订)》的相关规定，企业在注销时应当确保清算义务得到履行，严格企业主体责任。因此，在处理已申请未立案案件时，您需要确保企业的行为符合法律法规的要求。
• 如果企业确实存在无法解决的案件或债务问题，您可能需要考虑通过普通注销程序进行注销，并按照相关法律法规的要求进行清算和公告。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您在处理过程中遇到任何问题或需要进一步的帮助，请随时咨询相关专业人士或登记机关。