综合工时制的计算周期既可以是按年计算，也可以是按月计算，具体取决于审批机关的批准以及劳动合同或集体合同的约定。以下是对这一问题的详细分析：

一、法律规定

根据《劳动部关于企业实行不定时工作制和综合计算工时工作制的审批办法》第五条的规定，企业实行综合计算工时工作制，需要报经劳动行政部门批准。在批准的文件中，会明确综合计算工时工作制的计算周期，这个周期可以是周、月、季、年，但每日最长工作时间一般不得超过11小时，且在综合计算周期内，某一具体日（或周）的实际工作时间可以超过8小时（或40小时），但综合计算周期内的总实际工作时间不应超过总法定标准工作时间。

二、计算周期的具体应用

1. 按月计算：

   • 如果审批机关批准的综合工时制计算周期为月，那么企业可以按照月来计算员工的工作时间。
   • 在这种情况下，员工在某个月内的工作时间可能超过标准的8小时/天或40小时/周，但只要在综合计算周期（即一个月）内，总工作时间不超过法定标准工作时间（即月平均工作天数乘以8小时），就不视为加班。

2. 按年计算：

   • 如果审批机关批准的综合工时制计算周期为年，那么企业需要按照年来计算员工的工作时间。
   • 在这种情况下，员工在某个月或某个季度内的工作时间可能大幅超过标准工作时间，但只要在综合计算周期（即一年）内，总工作时间不超过法定标准工作时间（即年平均工作天数乘以8小时），同样不视为加班。

三、劳动合同或集体合同的约定

除了审批机关的批准外，综合工时制的计算周期还可以在劳动合同或集体合同中约定。如果劳动合同或集体合同中明确规定了综合工时制的计算周期，那么企业应当按照约定来执行。

四、实际操作建议

1. 明确计算周期：企业在实行综合工时制时，应当明确计算周期，并在劳动合同或集体合同中予以约定，以避免后续纠纷。
2. 合理安排工作时间：企业应当根据综合工时制的计算周期，合理安排员工的工作时间，确保员工在综合计算周期内的总工作时间不超过法定标准工作时间。
3. 遵守加班规定：如果员工在综合计算周期内的总工作时间超过了法定标准工作时间，企业应当按照法律规定支付加班费或安排补休。

五、法律后果

如果企业未按照审批机关批准的计算周期或劳动合同、集体合同的约定实行综合工时制，或者未合理安排员工的工作时间导致员工加班未得到补偿，企业可能面临劳动行政部门的处罚以及员工的民事索赔。

总结来说，综合工时制的计算周期既可以是按年计算也可以是按月计算，具体取决于审批机关的批准以及劳动合同或集体合同的约定。企业在实行综合工时制时应当明确计算周期并合理安排员工的工作时间以避免法律纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。