工程不合格时，是否可以拒付工程款需根据具体情况判断。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
一、可以拒付工程款的情况
合同有明确约定：
- 若建设工程施工合同中明确规定，在工程质量不合格的情况下，发包方有权不支付工程款或按不合格程度扣减工程款，那么发包方可依据合同条款执行。例如，合同中可能约定若工程质量验收不达标，承包方需返工至合格；若多次返工仍不合格，发包方有权拒付剩余工程款。
工程未经验收或验收不合格且未修复：
- 根据《中华人民共和国民法典》第七百九十九条，建设工程需经验收合格后，发包方才需支付价款。若工程未经竣工验收或验收不合格，且承包方未进行修复，发包方有权拒绝支付工程款。若承包方后续修复并经验收合格，发包方应支付工程款，但修复费用由承包方承担。
无法修复的不合格工程：
- 若工程质量问题严重，属于不可修复或修复后仍无法达到合同约定标准，发包方不仅无需支付剩余工程款，还有权要求承包方承担赔偿损失等违约责任。
二、可能仍需支付工程款的情况
工程已部分合格：
- 若建设工程整体质量不合格，但其中部分工程质量符合合同约定或相关标准，发包方应对这部分合格工程支付工程款。例如，在大型建筑项目中，水电安装工程质量合格，而主体结构存在问题，发包方应支付水电安装部分的工程款。
发包方擅自使用：
- 若建设工程未经竣工验收，发包方擅自使用后，又以质量问题为由主张不支付工程款的，通常不予支持。但承包方仍需在建设工程的合理使用寿命内对地基基础工程和主体结构质量负责。
三、处理建议
协商先行：
- 遇到工程质量问题时，发包方与承包方应首先通过协商寻求解决方案。双方可以就修复责任、工程款支付等问题进行友好沟通，以达成共识。
第三方评估：
- 若协商无果，可引入第三方机构进行工程质量评估。评估机构应具备相应的资质和经验，能够出具客观、公正的评估报告，以明确责任归属。
法律途径：
- 当协商与评估均无法解决问题时，可通过法律途径维护自身权益。发包方可以依据合同条款和法律规定，向法院提起诉讼或申请仲裁，要求承包方承担修复责任或赔偿损失。
四、法律依据
- 《中华人民共和国民法典》第八百零一条：因施工人的原因致使建设工程质量不符合约定的，发包人有权请求施工人在合理期限内无偿修理或者返工、改建。经过修理或者返工、改建后，造成逾期交付的，施工人应当承担违约责任。
- 《中华人民共和国民法典》第七百九十九条：建设工程竣工后，发包人应当根据施工图纸及说明书、国家颁发的施工验收规范和质量检验标准及时进行验收。验收合格的，发包人应当按照约定支付价款，并接收该建设工程。
- 《建设工程质量管理条例》：工程质量不合格属于承包商违约行为，业主有权按合同规定要求其改正；如违约严重可解除合同并不支付全部工程款。
- 最高人民法院《关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》：因承包人的原因造成建设工程质量不符合约定，承包人拒绝修理、返工或改建，发包人请求减少支付工程价款的，人民法院应予支持。
在处理此类纠纷时，建议双方保持沟通、理性协商，并必要时寻求专业法律支持。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。