结论前置：在工程质量不合格的情况下，发包人是否可以拒付工程款需根据具体情况判断。若工程可修复，承包方应承担修复责任，修复后通过验收则发包方应支付工程款；若工程无法修复，发包方有权解除合同并拒付工程款，同时可要求承包方赔偿损失。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据
《中华人民共和国民法典》：
- 第八百零一条：因施工人原因致使建设工程质量不符合约定的，发包人有权请求施工人在合理期限内无偿修理或者返工、改建。经过修理或返工、改建后造成逾期交付的，施工人应承担违约责任。
- 第七百九十九条：建设工程验收合格的，发包人应当按照约定支付价款并接受该工程。
- 第八百条：勘察、设计的质量不符合要求或未按照期限提交勘察、设计文件的，勘察人、设计人应承担违约责任。
《建设工程质量管理条例》：工程质量不合格属于承包商违约行为，业主有权按合同规定要求其改正；如违约严重可解除合同并不支付全部工程款。
最高人民法院《关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》：
- 第十二条：因承包人的原因造成建设工程质量不符合约定，承包人拒绝修理、返工或改建，发包人请求减少支付工程价款的，人民法院应予支持。
- 相关条款还规定，合同无效且修复后的建设工程经竣工验收不合格，承包人请求支付工程价款的，不予支持。
二、工程质量不合格的处理方式
工程质量不合格但可修复的情况：
- 修复责任：承包方应在合理期限内承担修复责任，以达到合同约定的质量标准。
- 工程款支付：修复完成并通过验收后，发包方应按合同约定支付工程款。
- 违约责任：若承包方拒绝修复或无法在规定期限内完成修复，发包方可依据合同约定追究其违约责任。
工程质量不合格且无法修复的情况：
- 合同解除：发包方有权解除合同，并拒绝支付工程款。
- 赔偿责任：承包方因工程质量不合格且无法修复而承担违约责任，包括赔偿损失、支付违约金等。
三、拒付工程款的前提和条件
- 明确的质量问题：需有专业的质量检测机构出具检测报告或鉴定意见，证明工程质量确实不合格。
- 履行通知和催告义务：发包人应及时通知承包人工程质量问题，并要求其在合理期限内整改。若承包人未采取有效措施整改，发包人才可进一步采取措施，包括拒付工程款。
四、实际操作中的注意事项
- 签订详细合同条款：合同中应明确约定工程质量标准、验收程序、质量争议解决方式及工程款支付条件等，以便在发生争议时有据可依。
- 加强过程监督和管理：发包方在工程建设过程中应加强对工程质量的监督和管理，及时发现并解决质量问题，避免问题扩大化。
- 及时验收：建设工程竣工后，发包人应根据施工图纸、说明书及国家颁发的施工验收规范和质量检验标准及时进行验收，确保工程质量符合约定。
- 保留证据：在发现工程质量问题后，发包人应及时保留相关证据，如照片、视频、检测报告等，以便在后续争议解决中证明自己的主张。
五、争议解决途径
- 协商解决：双方可首先尝试通过协商解决工程质量和工程款支付问题，以节省时间和成本。
- 法律途径：若协商不成，可通过诉讼或仲裁等方式解决争议。在诉讼过程中，发包方需提供充分证据证明工程质量不合格及已履行通知和催告义务。
综上所述，处理工程质量不合格时的工程款支付问题需综合考虑多个因素，包括工程质量问题的严重程度、是否可修复以及合同约定和法律规定等。在实际操作中，建议双方遵循法律法规，通过协商或法律途径妥善解决争议。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。