在承包工程质量不合格的情况下，付款问题需根据质量问题的可修复性、责任归属及合同约定来决定。以下是对此问题的详细分析：

一. 核实与评估质量问题

• 首先，需要组织专业人员对工程质量进行全面检查，确保评估的准确性和客观性。这一步骤是后续处理的基础。
• 接着，判断质量问题是否属于可修复范畴，以及修复的难度和成本。这将直接影响付款的处理方式。

二. 处理原则与方式

1. 可修复情形：

   • 承包方应按发包方要求修复至合格标准，费用由承包方自理。修复期间，发包方可以扣留不超过10%的质量保证金，但不影响其他工程款的正常支付。
   • 修复完成后，经发包方或第三方验收合格，发包方应支付剩余工程款。

2. 无法修复或拒绝修复情形：

   • 发包方有权拒绝支付剩余工程款，并可根据《民法典》要求承包方承担违约责任及赔偿损失。
   • 若已部分或全部支付工程款，发包方可要求承包方返还或就不合格部分折价补偿，必要时可通过法律途径解决。

三. 争议解决机制

• 在处理过程中，双方应首先尝试通过协商解决争议，明确责任归属、损失范围及工程款处理方式。
• 若协商不成，可共同委托有资质的工程质量鉴定机构进行鉴定，以鉴定结果作为处理依据。
• 如仍无法解决，任何一方均可向有管辖权的人民法院提起诉讼或依据合同中的仲裁条款申请仲裁。

四. 法律依据

• 根据《中华人民共和国民法典》、《建设工程质量管理条例》等相关法律法规，承包方对施工质量负责，若因施工不当造成质量问题，应承担主要责任。
• 同时，合同中的约定也是处理此类问题的重要依据。双方应仔细审查合同条款，确保明确无误。

综上所述，在承包工程质量不合格的情况下，付款问题需综合考虑质量问题的性质、责任归属及合同约定。双方应保持理性沟通，依法依规进行处理。如有进一步需要，您可以继续咨询我。