工程质量不合格时，一般情况下不可以主张全额工程款，但可根据具体情况主张部分工程款或要求修复费用等。以下从不同角度进行分析：
一、工程质量不合格与工程款支付的基本原则
在建设工程合同中，工程质量是核心要素之一。根据《中华人民共和国民法典》及相关法律法规，承包人应按照合同约定的质量标准完成工程建设。若工程质量不合格，发包人有权拒绝支付或减少支付工程款，这是基于合同履行和公平原则的基本要求。
二、工程质量不合格时的法律后果
拒绝支付工程款：
- 若工程质量不符合合同约定或国家强制性标准，发包人有权拒绝支付全部或部分工程款，直至工程质量达到合格标准。
要求修复或返工：
- 发包人可以要求承包人对不合格工程进行修复或返工，直至达到合同约定的质量标准。修复或返工的费用通常由承包人承担。
主张违约责任：
- 若因工程质量不合格给发包人造成损失，发包人还可以主张违约责任，要求承包人赔偿损失。
三、特殊情况下的工程款支付
部分合格工程：
- 若工程部分合格、部分不合格，对于合格部分，承包人仍有权主张工程款。但需注意，这部分工程款可能因不合格部分的存在而受到一定影响，如发包人可能主张从总工程款中扣除因不合格部分导致的损失或修复费用。
修复后合格：
- 若承包人对不合格工程进行了修复，并达到了合同约定的质量标准，那么对于修复后的工程部分，承包人可以主张相应的工程款。但修复费用通常由承包人自行承担，除非合同另有约定。
四、法律建议与注意事项
合同约定：
- 在签订建设工程合同时，应明确约定工程质量标准、验收程序、工程款支付条件等关键条款。这有助于在发生争议时，依据合同约定进行解决。
证据保留：
- 承包人应保留好与工程质量相关的所有证据，如施工记录、验收报告、检测报告等。这些证据在主张工程款或应对发包人主张时至关重要。
及时沟通与协商：
- 在发现工程质量问题时，承包人应及时与发包人进行沟通，协商解决方案。避免问题扩大化，导致更严重的法律后果。
法律途径：
- 若双方无法就工程质量问题达成一致意见，可以通过法律途径解决争议。如提起诉讼或申请仲裁等。在诉讼或仲裁过程中，应依据相关法律法规和合同约定进行陈述和辩论。
举例说明：假设一个建设工程合同中约定了工程质量标准为“合格”，并明确了工程款支付条件为“工程验收合格后支付”。在施工过程中，发现部分工程存在质量问题，未达到合同约定的标准。此时，发包人有权拒绝支付这部分不合格工程的工程款，并要求承包人进行修复。若承包人修复后达到了合格标准，那么对于修复后的工程部分，承包人可以主张相应的工程款。但修复费用应由承包人自行承担。
如有更多关于建设工程领域的法律问题，欢迎直接向我咨询。