面对公司扣孕妇工资的情况，这确实是违法行为，您有权依法维护自己的合法权益。以下是我为您详细梳理的应对步骤和建议：
一、明确法律依据
首先，您需要了解相关的法律法规，以确保自己的权益得到充分保护。根据《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国劳动合同法》、《女职工劳动保护特别规定》以及《中华人民共和国妇女权益保障法》等，明确规定了女职工在孕期、产期、哺乳期内的特殊劳动保护权益。这些法律条款明确指出，用人单位不得因女职工怀孕、生育、哺乳而降低其工资、予以辞退或与其解除劳动（聘用）合同。
二、采取具体维权措施
了解具体情况并保留证据
- 您需要详细了解工资被扣的具体原因和金额，确认是否存在误解或沟通不畅导致的问题。
- 在此过程中，务必保留好所有与扣工资相关的证据，如工资条、银行流水、劳动合同、沟通记录（包括聊天记录、通话录音等）。这些证据在后续的处理过程中将起到关键作用。
与用人单位协商
- 在确认情况后，您应首先尝试与用人单位的人力资源部门或直接上级进行沟通，表达疑虑和不满，询问扣工资的具体依据，并要求用人单位提供相关的书面证明或解释。
- 您可以考虑以书面形式发送正式的沟通函件，明确指出扣工资行为违法，要求单位足额支付被扣除的工资，并设定合理的解决期限。
寻求工会帮助
- 如果用人单位有工会组织，您可以向工会反映情况，请求工会介入调解。工会有责任维护职工的合法权益，会协助您与用人单位进行协商，推动问题得到妥善解决。
向相关部门投诉
- 若与用人单位协商无果，您可以向当地的劳动保障监察部门或妇联等组织投诉。提交详细的投诉材料，包括工资单、劳动合同、扣工资的证据等。
- 劳动保障监察部门有权对用人单位的违法行为进行调查和处理，并根据调查结果作出相应的处罚。
申请劳动仲裁或提起诉讼
- 如果投诉未能解决问题，您可以向当地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁。申请仲裁时，需提交仲裁申请书及相关证据材料。仲裁委员会将安排开庭审理，并根据事实作出裁决。
- 如对劳动仲裁结果不满意，或用人单位不履行仲裁裁决，您可以向人民法院提起诉讼。法院将根据双方提供的证据和相关法律规定进行审理，并作出具有法律效力的判决。
三、注意事项
- 保留证据：在整个维权过程中，您务必保留好相关证据，以便在需要时提供证明。
- 了解法律程序：提前了解相关的法律程序和维权途径，确保自己的权益得到有效保障。
- 寻求专业帮助：如有需要，您可以咨询律师或法律援助机构的专业人士，获取更具体的法律建议和帮助。
总之，面对公司扣孕妇工资的情况，您应首先尝试与用人单位沟通解决问题。如果沟通无果，可以依法向相关部门投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼来维护自己的合法权益。在整个过程中，保留好相关证据并寻求专业法律援助是非常重要的。希望这些建议能对您有所帮助。