协议书公证书被撤销后，并不直接导致协议无效，赔偿责任的承担需根据具体情况分析。以下从不同角度为你详细阐述：
一、公证书被撤销与协议效力的关系
公证书的作用：公证书是公证机构根据当事人的申请，依照法定程序对民事法律行为、有法律意义的事实和文书的真实性、合法性予以证明的活动。它本身并不创设或改变民事法律行为的效力，而是对已经存在的民事法律行为进行证明。
公证书被撤销的影响：如果公证书被撤销，通常意味着公证机构认为该公证书存在错误或违法情形，需要予以纠正。但这并不直接等同于被公证的协议本身无效。协议的效力取决于其内容是否违反法律、行政法规的强制性规定，是否违背公序良俗，以及当事人是否具有相应的民事行为能力等。
二、赔偿责任的分析
因公证机构过错导致公证书被撤销：
- 如果公证书被撤销是由于公证机构的过错（如未严格审查、程序违法等）导致的，那么根据《中华人民共和国公证法》的相关规定，公证机构应当承担相应的赔偿责任。这种赔偿通常限于因公证机构过错给当事人造成的直接经济损失。
- 赔偿范围：可能包括因公证书被撤销而导致的交易失败、额外费用支出等直接经济损失。但需要注意的是，赔偿范围通常不包括间接损失或预期利益损失。
因协议本身问题导致公证书被撤销（协议实际无效或可撤销）：
- 如果协议本身存在无效或可撤销的情形（如违反法律强制性规定、欺诈、胁迫等），即使公证书未被撤销，协议也可能被认定为无效或可撤销。在这种情况下，公证书被撤销只是反映了协议本身的问题，赔偿责任应由导致协议无效或可撤销的过错方承担。
- 赔偿原则：根据《中华人民共和国民法典》中关于合同无效或可撤销的规定，过错方应当赔偿对方因此受到的损失。这种赔偿可能包括直接经济损失和合理的间接损失（如因处理纠纷而产生的费用等）。
混合过错情况：
- 在某些情况下，公证书被撤销可能既与公证机构的过错有关，也与协议本身的问题有关。这时，赔偿责任应根据双方的过错程度进行分担。
三、建议与行动
- 审查协议内容：首先，应仔细审查协议内容，确定其是否存在无效或可撤销的情形。
- 咨询专业意见：如果协议内容复杂或存在争议，建议咨询专业律师，以获取更准确的法律意见。
- 收集证据：在准备追究赔偿责任时，应收集相关证据，如公证书、协议文本、交易记录、沟通记录等，以证明自己的主张。
- 协商或诉讼：根据具体情况，可以选择与对方协商解决赔偿问题，或者通过诉讼途径维护自己的合法权益。
总结来说，协议书公证书被撤销后，赔偿责任需根据具体情况分析。如果因公证机构过错导致，公证机构应承担相应赔偿责任；如果因协议本身问题导致，则由过错方承担赔偿责任；在混合过错情况下，赔偿责任应根据双方过错程度分担。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。