结论：在这种情况下，离职证明与离职协议内容不一致时，离职协议通常更具法律效力，能证明是单位提出的离职，但具体还需结合实际情况和证据综合判断。以下为你详细分析：

离职证明与离职协议的法律效力

1. 离职证明：离职证明是用人单位与劳动者解除劳动关系的书面证明，通常包含劳动者的基本信息、在职时间、工作岗位以及离职原因等。虽然离职证明上写的是“个人原因离职”，但这并不一定代表真实情况，因为离职证明的内容有时可能受到用人单位单方面的影响或出于某种考虑而填写不准确。

2. 离职协议：离职协议是用人单位与劳动者就离职相关事宜达成的书面协议，具有合同性质。如果离职协议中明确约定了是单位提出的离职，并且双方都在协议上签字或盖章确认，那么这份协议就具有法律效力，能够证明离职的真实原因。

证据的认定与采信

在劳动争议中，证据的认定与采信是关键。如果劳动者能够提供离职协议作为证据，证明是单位提出的离职，而用人单位无法提供相反证据来推翻这一事实，那么劳动仲裁机构或法院通常会采信离职协议的内容。

可能的法律后果

1. 如果离职协议被采信：那么用人单位可能需要承担因违法解除劳动合同而应支付的经济补偿金或赔偿金等法律责任。具体金额根据劳动者的工龄、工资等因素确定。

2. 如果离职证明被错误采信：而实际上离职协议才是真实情况的反映，那么劳动者可能会面临无法获得应有补偿的风险。因此，劳动者在离职时应尽量保留好相关证据，如离职协议、聊天记录、邮件等，以备不时之需。

建议与措施

1. 收集并保留证据：劳动者在离职时，应尽可能收集并保留与离职相关的所有证据，包括离职协议、离职证明、聊天记录、邮件等。这些证据在后续可能发生的劳动争议中将起到至关重要的作用。

2. 咨询专业律师：如果劳动者对离职证明或离职协议的内容有疑问，或者担心自己的权益受到侵害，可以及时咨询专业律师。律师会根据具体情况为劳动者提供法律建议，帮助劳动者维护自己的合法权益。

3. 申请劳动仲裁：如果劳动者与用人单位在离职原因上存在争议，且无法通过协商解决，劳动者可以向当地劳动仲裁机构申请劳动仲裁。在仲裁过程中，劳动者需要提供充分的证据来支持自己的主张。

最后，离职证明与离职协议内容不一致时，应综合考虑双方提供的证据和实际情况来判断离职的真实原因。如果你还有其他关于劳动工伤或劳动仲裁方面的问题，可以直接向我咨询。