劳动者擅自离职后六年回单位要工资，单位一般无需支付，但需视具体情况而定。以下从不同角度进行分析：

1. 从劳动关系解除的角度
   劳动者擅自离职，通常可视为劳动者单方解除劳动合同的行为。根据《劳动合同法》规定，劳动者解除劳动合同，应当提前三十日以书面形式通知用人单位（试用期提前三日）。若劳动者未履行通知义务擅自离职，属于违法解除劳动合同，但这并不影响劳动关系自离职之日起实际解除的事实。劳动关系解除后，单位无需再支付工资，因为工资是劳动者提供劳动的对价，劳动关系不存在则支付工资的基础也不存在。

2. 从诉讼时效的角度
   根据《劳动争议调解仲裁法》规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。劳动者擅自离职后六年才主张工资，早已超过一年的仲裁时效。即使劳动者认为单位拖欠工资，也因时效届满而丧失胜诉权，单位可以提出时效抗辩，拒绝支付工资。

3. 从特殊情况的角度

   • 单位存在过错：如果劳动者擅自离职是因为单位存在未及时足额支付劳动报酬、未依法为劳动者缴纳社会保险费等违法行为，劳动者以此为由解除劳动合同的，单位应当支付工资及经济补偿。但劳动者需在离职后一年内主张权利，六年后再主张同样面临时效问题。
     
   • 劳动者提供部分劳动：若劳动者在擅自离职前提供了部分劳动，单位未支付相应工资，劳动者有权主张这部分工资。但同样受一年仲裁时效的限制，六年时间远超时效，单位可拒绝支付。
     
   • 单位认可债务：如果单位在劳动者离职后通过书面协议、承诺书等形式认可拖欠工资并同意支付，那么单位应当履行承诺。这种情况下，诉讼时效可能因单位认可债务而重新计算，但需要劳动者提供充分证据证明单位存在认可债务的行为。

建议：单位在处理此类问题时，应首先审查劳动者离职的原因、是否提供了劳动以及是否存在时效中断、中止等情形。如果确认无需支付工资，应向劳动者说明理由；如果存在特殊情况可能需要支付，建议与劳动者协商解决或通过法律途径处理。劳动者若有疑问，也可以直接向我咨询相关法律问题。