合同格式条款中规定的“先开票再付款”可以修改为“先付款再开票”，但需满足一定条件并遵循合法程序。具体分析如下：

1. 合同修改的合法性基础
   根据《民法典》第四百九十六条，格式条款是当事人为了重复使用而预先拟定，并在订立合同时未与对方协商的条款。但格式条款并非不可修改，若双方协商一致，可对格式条款进行变更或补充。因此，只要双方达成合意，即可将“先开票再付款”修改为“先付款再开票”。

2. 修改程序与形式要求

   • 协商一致原则：修改合同条款需双方意思表示一致，建议通过书面形式（如补充协议、修订条款确认书）固定变更内容，避免口头约定引发争议。
     
   • 格式条款的特别提示义务：若原条款为格式条款，提供方需履行提示说明义务（《民法典》第四百九十六条第二款）。修改时，提供方应明确告知对方条款变更内容及法律后果，否则可能因未尽提示义务导致条款不成为合同内容。

3. 修改后的法律效果

   • 付款与开票顺序的调整：修改后，付款义务的履行不再以开票为前提，买方需先履行付款义务，卖方随后开具发票。此调整可能影响双方现金流安排，需在合同中明确违约责任（如逾期付款的违约金、逾期开票的赔偿责任）。
     
   • 税务合规性：根据《发票管理办法》第十九条，销售方在收款后开具发票是法定义务。修改条款后，卖方仍需在收款后及时开票，否则可能面临税务行政处罚。买方亦需确保付款后取得合法发票，否则可能影响税前扣除等权益。

4. 实务建议

   • 明确条款表述：建议将修改后的条款表述为“买方应于XX日前支付合同款项，卖方收到款项后XX日内开具等额合法发票”，避免歧义。
     
   • 关联条款同步调整：若原合同涉及违约金、解除权等条款，需同步审查是否需因付款顺序调整而修改，确保合同权利义务平衡。
     
   • 保留协商证据：修改过程中，建议通过邮件、微信等书面方式留存双方协商记录，证明修改系双方真实意思表示。

总结：合同格式条款的修改需以双方协商一致为前提，修改后的条款不得违反法律强制性规定（如税务合规性）。若需进一步审查合同条款或设计修改方案，可直接向我咨询具体合同内容及交易背景。