员工当然可以不同意公司临时更改薪酬制度以及提成百分比。以下从几个角度为你详细分析：
法律角度
劳动合同的变更需协商一致：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同的变更应当遵循平等自愿、协商一致的原则。薪酬制度以及提成百分比作为劳动合同的重要组成部分，其变更同样需要用人单位与劳动者协商一致，并采用书面形式进行确认。
- 如果公司未经员工同意，单方面更改薪酬制度或提成百分比，这种行为可能构成违法变更劳动合同，员工有权拒绝执行，并可以要求公司按照原劳动合同的约定履行义务。
公司规章制度需合法合规：
- 即使公司通过规章制度来规定薪酬制度或提成百分比的变更，这些规章制度也必须符合法律法规的规定，且经过民主程序制定，并向员工公示或告知。
- 如果公司的规章制度违反了法律法规的强制性规定，或者未经民主程序制定、未向员工公示或告知，那么这些规章制度对员工不具有约束力，员工可以拒绝执行其中关于薪酬制度或提成百分比的变更。
实际操作角度
员工有权表达异议：
- 当公司提出更改薪酬制度或提成百分比时，员工有权表达自己的异议和不满。员工可以通过与公司协商、提出书面意见等方式来维护自己的合法权益。
- 如果公司坚持单方面更改，员工可以考虑向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
注意保留证据：
- 在与公司就薪酬制度或提成百分比变更进行协商或争议的过程中，员工应注意保留相关证据，如劳动合同、工资条、公司规章制度、协商记录等。
- 这些证据在后续的劳动争议处理中可能起到关键作用，有助于员工证明自己的主张和权益。
可能的法律后果
公司可能面临法律责任：
- 如果公司未经员工同意单方面更改薪酬制度或提成百分比，且被认定为违法变更劳动合同，那么公司可能面临支付经济补偿金、赔偿金等法律责任。
- 同时，公司的这种行为也可能损害其声誉和形象，对公司的长期发展产生不利影响。
员工权益得到保障：
- 通过法律途径维护自己的合法权益，员工可以确保自己的薪酬和提成不受公司单方面更改的影响。
- 这也有助于维护劳动市场的公平和正义，促进和谐劳动关系的建立。
建议：当公司提出更改薪酬制度或提成百分比时，员工应首先与公司进行协商，表达自己的异议和不满。如果协商无果，员工可以考虑向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。在此过程中，员工应注意保留相关证据，以便在后续的劳动争议处理中证明自己的主张和权益。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。