您好，关于您提出的“母亲不配合办出生证明是否违法”的问题，这主要涉及到的是父母对子女应尽的义务以及相关法律法规的规定。
首先，我们需要明确的是，出生医学证明是新生儿获得法律身份的重要依据，它对于孩子的落户、入学、接种疫苗等后续事宜都至关重要。因此，父母双方都有责任和义务配合办理出生医学证明。
从法律层面来看，虽然直接的法律法规可能并未明确规定“母亲不配合办出生证明即违法”，但根据《中华人民共和国户口登记条例》等相关规定，婴儿出生后一个月以内，其父亲、母亲或者其他监护人应当向户口所在地公安派出所申报出生登记，而申报出生登记需要提交《出生医学证明》等材料。这意味着，父母双方都有责任提供必要的材料和配合办理相关手续，以确保孩子能够顺利获得法律身份。
在实际操作中，如果母亲不配合办理出生证明，可能会导致孩子无法及时落户，进而影响其享受基本权益，如接种疫苗、入学等。这种情况下，虽然母亲的行为可能不直接构成违法，但她确实未尽到作为父母应尽的义务，且可能对孩子的权益造成损害。
进一步地，如果因为母亲的不配合导致孩子权益受到严重侵害，比如长期无法落户、无法享受基本公共服务等，那么这种行为在道德和伦理层面都是不可接受的，且可能引发法律纠纷。在极端情况下，如果母亲的行为构成对未成年子女权益的严重侵犯，还可能涉及法律责任的问题，尽管这通常需要通过具体的法律程序和证据来判定。
建议：
沟通协商：首先，建议父亲与母亲进行充分的沟通协商，了解她不配合的具体原因，并尝试解决这些问题。
寻求第三方帮助：如果沟通无果，可以寻求家庭成员、亲友或社区工作人员的帮助，进行调解和劝说。
法律途径：如果母亲仍然拒绝配合，且孩子的权益因此受到严重影响，父亲可以考虑通过法律途径来维护孩子的权益，比如向法院提起诉讼或申请相关法律援助。
总之，虽然母亲不配合办出生证明可能不直接构成违法，但她确实未尽到作为父母应尽的义务。在这种情况下，建议通过沟通协商、寻求第三方帮助或法律途径来解决问题，以确保孩子能够顺利获得法律身份并享受基本权益。