加班工资两倍的计算并不需要扣除月工资里的一天，而是直接根据加班的小时数和小时工资标准来计算。下面我将从多个角度为您详细解释：

一、加班工资的计算基础

根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，劳动者在休息日（通常是周六、周日）加班的，用人单位应当安排劳动者补休；不能安排补休的，应当按照不低于劳动者本人日或小时工资标准的200%支付加班工资。这里的“200%”即是我们通常所说的“两倍”加班工资。

二、加班工资的具体计算方法

1. 确定小时工资标准：

   • 首先，需要确定劳动者的小时工资标准。这通常可以通过将劳动者的月工资总额除以月计薪天数（通常为21.75天，这是根据全年365天减去104天休息日和11天法定节假日后，再除以12个月得出的平均值），再除以每日工作小时数（通常为8小时）来得出。

2. 计算加班工资：

   • 加班工资 = 小时工资标准 × 加班小时数 × 200%
   • 例如，如果劳动者的小时工资标准是50元，周末加班了4小时，那么加班工资就是50元/小时 × 4小时 × 200% = 400元。

三、关于“扣除月工资里的一天”的误解

• 无需扣除：在计算加班工资时，并不需要从劳动者的月工资中扣除任何一天或任何金额。加班工资是额外支付的，与劳动者的正常工资是分开的。
• 正常工资与加班工资的区别：正常工资是劳动者在正常工作时间内提供的劳动所应得的报酬，而加班工资是劳动者在超出正常工作时间外提供的劳动所应得的额外报酬。

四、特殊情况下的加班工资计算

• 法定节假日加班：如果劳动者在法定节假日（如春节、国庆节等）加班，用人单位应当按照不低于劳动者本人日或小时工资标准的300%支付加班工资。
• 工作日加班：如果劳动者在工作日延长工作时间的，用人单位应当按照不低于劳动者本人小时工资标准的150%支付加班工资。

五、法律建议

• 保留证据：劳动者在主张加班工资时，应当保留好加班的证据，如加班通知、考勤记录等，以便在发生争议时能够证明自己的加班事实。
• 及时维权：如果用人单位未按照法律规定支付加班工资，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

希望以上解答能够帮助您更好地理解加班工资的计算方法。如果您有任何其他法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。