超市员工未查好保质期，可能面临的处罚需分情况讨论，具体如下：

1. 内部管理处罚
   超市作为用人单位，通常会依据内部规章制度对员工进行管理。若员工未尽到保质期检查义务，可能面临警告、扣减绩效奖金、降职降薪等内部处分。此类处罚需以超市明文规定且已向员工公示为前提，否则可能因程序瑕疵被认定为无效。

2. 民事赔偿责任
   若因员工未检查保质期导致销售过期商品，超市需先对消费者承担民事赔偿责任（如退换货、赔偿损失等）。若员工存在重大过失或故意行为（如明知过期仍上架），超市在赔偿后可依据《民法典》第1191条向员工追偿，但需证明员工过错与损害结果间的直接因果关系。

3. 行政处罚风险
   根据《食品安全法》第124条，超市销售过期食品可能面临没收违法所得、罚款（最低5万元起，情节严重可高达货值金额10倍或30万元以下）等行政处罚。但行政责任通常由超市作为经营者承担，员工个人一般不直接受罚，除非其同时具备经营者身份（如个体工商户）。

4. 刑事责任边界
   若销售过期食品导致严重食物中毒或其他严重食源性疾病，可能触犯《刑法》第143条生产、销售不符合安全标准的食品罪。但刑事责任主体通常是超市（单位犯罪）或直接负责的主管人员，普通员工仅在直接参与犯罪行为（如伪造生产日期）时才可能被追责。

建议：超市应完善保质期检查流程（如双人核对、系统预警），员工需严格遵守操作规范。若已发生纠纷，建议立即下架问题商品、固定证据（如监控录像、检查记录），并咨询专业律师评估责任划分。如有进一步疑问，可直接向我提问。