员工离职后起诉公司的时效问题，确实存在，且需根据争议类型和具体情况来判断。以下是对这一问题的详细分析：
一、劳动争议类纠纷的时效
对于劳动争议类纠纷，如工资、福利、解除劳动关系等争议，主要适用《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的相关规定：
一般时效：劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。例如，员工离职时公司未支付经济补偿金或未结清工资，仲裁时效从离职当日起算一年。
特殊时效：对于劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生的争议，劳动者申请仲裁不受一年时效期间的限制；但是，劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。这意味着，如果公司长期拖欠工资，员工在离职后一年内仍可申请仲裁。
时效中断与中止：在特定情况下，如当事人向对方当事人主张权利、请求权利救济或对方同意履行义务，仲裁时效可以中断并重新计算。同时，因不可抗力或其他正当理由导致无法申请仲裁的，时效可以中止，待原因消除后继续计算。
二、一般民事纠纷类的时效
如果员工与公司之间的纠纷属于一般民事纠纷，如违反保密协议、竞业限制协议或侵占公司财产等侵权纠纷，则适用《中华人民共和国民法典》关于诉讼时效的规定：
诉讼时效期间：一般为三年，从权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。例如，员工离职后发现公司侵犯其商业秘密，诉讼时效一般为三年。
最长保护期限：自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护。但在特殊情况下，法院可以根据权利人的申请决定延长。
三、实际操作建议
及时了解权利状况：员工在离职后应及时了解自己的权利状况，包括是否拖欠工资、是否违反保密协议等，以便在规定的时效期间内采取相应的法律行动。
准备充分证据：无论是申请仲裁还是提起诉讼，员工都需要准备充分的证据来支持自己的主张。这包括劳动合同、工资单、保密协议、竞业限制协议等文件，以及可能的证人证言、录音录像等证据。
选择合适的法律途径：根据争议类型和具体情况，员工可以选择申请仲裁或提起诉讼来维护自己的权益。对于劳动争议类纠纷，一般需要先申请仲裁，对仲裁裁决不服的再提起诉讼；对于一般民事纠纷类，则可以直接向人民法院提起诉讼。
举例说明：假设员工小张于2023年1月1日离职，离职时公司未支付其最后一个月的工资。根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的规定，小张应在离职之日起一年内（即2024年1月1日前）申请仲裁来维护自己的权益。如果小张在离职后才发现公司侵犯了其商业秘密，且该侵权行为持续存在，那么小张可以在知道或应当知道权利受损之日起三年内（即从发现侵权行为之日起三年内）向人民法院提起诉讼。
综上所述，员工离职后起诉公司的时效问题需根据争议类型和具体情况综合判断。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。