首先，我们要明确一点：如果公司使用假名进行经营，并且现在已经过了起诉时间，那么确实面临一些法律上的困境。不过，别担心，我们可以一起探讨一下可能的解决办法。

1. 了解具体情况：

   • 首先要详细了解使用假名的原因、持续的时间、以及是否对公司或他人造成了实际损害。
   • 接着，需要确认所谓的“过了起诉时间”是指哪个具体的时间点，以及是否真的已经错过了法定的起诉期限。

2. 分析法律后果：

   • 使用假名经营可能涉及违反公司法、商业登记法规等，可能会面临行政处罚或民事责任。
   • 如果确实已经超过了起诉时间，那么可能无法再通过诉讼来追究相关责任，但这并不意味着没有其他救济途径。

3. 探讨解决方案：

   • 与受害方协商：如果公司使用假名对他人造成了损害，可以尝试与受害方进行协商，通过赔偿或其他方式来解决纠纷。
   • 向监管部门举报：虽然可能无法起诉，但可以向相关监管部门举报公司的违法行为，由监管部门进行调查和处理。
   • 内部整改：立即停止使用假名，进行内部整改，确保公司的经营行为符合法律法规的要求，以避免未来可能出现的法律风险。

4. 预防未来风险：

   • 加强公司内部的法律意识和合规培训，确保所有经营活动都符合法律法规的要求。
   • 定期对公司的经营行为进行自查和审计，及时发现并纠正可能存在的问题。

综上所述，虽然公司使用假名并且已经过了起诉时间确实带来了一些法律上的困扰，但通过详细了解情况、分析法律后果、探讨解决方案以及预防未来风险，我们仍然可以找到一些有效的办法来应对这个问题。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。